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标题:【求助】帮我看一下2D图

sistis[使用道具]
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【求助】帮我看一下2D图

各位,帮我看看2D图,找找原因。上样量少了,点就少,多了就有横条纹,聚焦不好。还有就是这种连续的横纹。


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2014-6-14 17:30
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zhenxin[使用道具]
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2-DE出现横纹原因一般有以下几种:
1、蛋白未充分溶解
2、加入样品的pH过低(在酸性末端出现这种情况)
3、干扰物质存在,非蛋白杂质在样品中能干扰等电聚焦,在最后的结果中产生水平条纹
4、样品中存在离子去污剂
5、聚焦不充分
6、聚焦过度(>100,000Vh)
7、如果是水平条带横贯凝胶,可能是因为在琼脂糖覆盖层中或平衡液中很有杂质
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sistis[使用道具]
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回复 #2 zhenxin 的帖子

非常感谢,不过有没有什么具体的原因,针对我的这几块的。
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zhenxin[使用道具]
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第一张胶可能是干扰物质的存在,因为非蛋白杂质在样品中能干扰等电聚焦,会产生水平条纹。可以用丙酮沉淀或用clean-up试剂盒解决这个问题。
第二张胶中间扭曲的部分,可能是因为SDS-PAGE胶没有完全聚合,聚合速度过快或在灌胶时渗漏而使其不均匀造成的。样品中盐离子过多也会干扰聚焦。
第三张胶还可以
最后一张图蛋白集中在酸性端,可能是因为加入的样品pH过低,可以加入一些碱性IPG缓冲液;聚焦也很不充分。
据我的经验,在实际操作中,一般出现横纹大多数是因为样品制备和聚焦不好两个原因。尤其是样品制备非常重要,保证需要的蛋白充分的溶解,干扰的物质尽量的去除。
祝好运!
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sistis[使用道具]
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酸性IPG缓冲液是什么?如何保证需要的蛋白充分溶解?
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