蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【求助】关于蛋白质结构分析软件

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴
打印 | 推荐 | 订阅 | 收藏

标题:【求助】关于蛋白质结构分析软件

wawa[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 71235
精华 0
积分 440
帖子 560
信誉分 100
可用分 3618
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-8-23
状态 离线
1

发表于 2014-6-18 10:38 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】关于蛋白质结构分析软件


求助各位大匣有没有蛋白质结构分析的软件
还有就是蛋白质表达中通常选取什么样的片段来表达？
十分感谢！
顶部
mimili_901[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 73543
精华 0
积分 564
帖子 723
信誉分 102
可用分 4458
专家分 20
阅读权限 255
注册 2011-9-24
状态 离线
2

发表于 2014-6-18 10:39 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

我也想知道啊！
顶一下！
刚才上网查到论坛里提到的网站预测，
但是出来是一堆数据，
根本看不懂，
我想的是预测结果直接出来就是一个三维图片，
不知这样的预测软件有吗？
恳求高手们指点一下！
我和楼上的战友谢谢各位了！
顶部
vivian4123[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 75243
精华 0
积分 417
帖子 494
信誉分 100
可用分 3331
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
3

发表于 2014-6-18 10:39 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

swiss pdb-viewer,免费的。
顶部
hold住[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 75093
精华 0
积分 566
帖子 832
信誉分 100
可用分 4962
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-19
状态 离线
4

发表于 2014-6-18 10:40 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

这个软件我倒是下载下来了，
但是我还是不会用，
不好意思！
为什么打开的文件都是pdb的文件啊？
怎么才能将自己的序列输入进去了?
谢谢！
顶部
ukonptp[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 103464
精华 5
积分 796
帖子 992
信誉分 110
可用分 5846
专家分 50
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
5

发表于 2014-6-18 10:40 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

“有没有蛋白质结构分析的软件”
google一下，一大把。二级结构分析有anthwin等，三级结构预测的有bbmouse 说的swiss，可以在线预测的，注册一个，把序列输进去就会把pdb文件给你返回来（前提是有相似的template）。modeller也是这方面的不错的软件。同时，swiss还提供配套的pdb view软件，可以打开返回的pdb文件进行分析和输出。
顶部
ukonptp[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 103464
精华 5
积分 796
帖子 992
信誉分 110
可用分 5846
专家分 50
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
6

发表于 2014-6-18 10:40 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
多看看manual吧，或者多到生物信息版search一下。
“为什么打开的文件都是pdb的文件啊？”还有别的格式，但主要是pdb。
“我想的是预测结果直接出来就是一个三维图片” 你用swiss打开预测到的pdb就是图片了。图片不光是用来看的，要分析啊。
“还有就是蛋白质表达中通常选取什么样的片段来表达”选择ORF或者你感兴趣的partial。看你是想做什么了。
bless～
顶部
yonger[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 74174
精华 0
积分 572
帖子 803
信誉分 100
可用分 4861
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-7
状态 离线
7

发表于 2014-6-18 10:41 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
我需要选取抗原性强的部分,而且不具有和其他蛋白质的同源性,我要表达的这个蛋白是一种酶,很古老了,
用什么样的软件比较好呢?
今天找了一天头都大了还是没头绪啊
关键是不太懂这方面的,
软件也不会用
很郁闷
顶部
987789[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 75248
精华 0
积分 479
帖子 598
信誉分 100
可用分 3870
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
8

发表于 2014-6-18 10:41 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

Anthwin 45 package ,有没有直接的网址呀？或者哪位好心人有下载下来的，能不能拿出来共享一下呀
顶部