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标题:【求助】请问MALDI-TOF-TOF的二级谱图出峰不好的原因？

dragonkilly[使用道具]
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发表于 2014-6-18 16:32 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】请问MALDI-TOF-TOF的二级谱图出峰不好的原因？


我在外单位进行了MALDI-TOF-TOF质谱鉴定，他们只给了我PMF图，
说二级谱图出峰不漂亮。
请问MALDI-TOF-TOF的二级谱图出峰不好的原因？
此外，虽然出峰不好，但仍然能得出其肽序列，对吗？为什么？
请指教。
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发表于 2014-6-18 16:33 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

用的是啥子质谱？
bruker 的还是ABI4700?
二级谱图出峰不好的原因：
一：峰的强度较低
二：肽段本身难以断裂
出峰不好得到的肽序列会可靠吗？
是PMF+ms/ms 的结果吗？
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shenkunjie[使用道具]
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发表于 2014-6-18 16:33 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


对一级PMF没影响，完全有可能。
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dragonkilly[使用道具]
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发表于 2014-6-18 16:34 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

用的是ABI4700－TOF-TOF。
他们没有给我提供二级的肽序列结果，只是PMF结果。
他们说当时仪器有点问题，做二级时谱图虽然不漂亮，但是软件却有强大的分析功能，能够分析出肽序列。可是仪器有点问题，对一级PMF就没影响吗？
请问这样对吗？
因为我对TOF-TOF不太懂。
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dragonkilly[使用道具]
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发表于 2014-6-18 16:34 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


QUOTE:
原帖由 shenkunjie 于 2014-6-18 16:33 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')


对一级PMF没影响，完全有可能。


请问为什么对一级PMF可以没影响，而会影响二级呢？
仪器有点问题，指的是什么意思呢？
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shenkunjie[使用道具]
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发表于 2014-6-18 16:35 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


QUOTE:
原帖由 dragonkilly 于 2014-6-18 16:34 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')



请问为什么对一级PMF可以没影响，而会影响二级呢？
仪器有点问题，指的是什么意思呢？

因为二级的ms/ms需要一定强度的一级离子才打的好看
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zranqi_1[使用道具]
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发表于 2014-6-18 16:35 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
做实验又不是找女人，图要那么漂亮干嘛？
不漂亮的图你也可以要求他们给你。
贴上一起看看。
你在哪做的4700？
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feima+[使用道具]
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发表于 2014-6-18 16:35 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

1.检查你的胰酶,Promega Golden Trypsin 不错
2.酶解要充分,不要怕自切
3.ESI源万不可用Ziptip除盐,因为质谱自带C18脱盐柱
4.蛋白回收要充分
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yonger[使用道具]
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发表于 2014-6-18 16:36 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

做质谱的单位如果设备没调好的话，出的结果是不可信的。
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