小中大首先是你的蛋白量下降的同时菌体(其他蛋白量)是否减少了?
如果也减少了,有以下两种可能。
IPTG有细胞毒性,会抑制菌生长甚至导致死亡,随着时间增长菌会裂解。即使你的IPTG浓度比较低,但随着表达异源蛋白的积累可能会导致细胞毒性,这也会导致菌体破裂,使获得蛋白量下降。
如果总蛋白量没变,只是目标条带变弱了,有可能是异源蛋白激活了菌体的蛋白酶系统,导致蛋白迅速降解。
另外30度表达蛋白,蛋白开始的表达速度会很快,此时蛋白降解速率小于表达速率,但是当蛋白浓度升高以后,蛋白降解速度加快,而表达速度由于细菌活力下降而降低,也会导致目标蛋白浓度下降。