【求助】蛋白质先酶切进行液相色谱-质谱鉴定与先过色谱...

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标题:【求助】蛋白质先酶切进行液相色谱-质谱鉴定与先过色谱...

baidukk[使用道具]
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发表于 2014-7-5 16:57 资料个人空间短消息加为好友

小中大

蛋白质先酶切进行液相色谱-质谱鉴定与先过色谱在酶切质谱鉴定的不同？
求教大家，谢谢啦！

yes4[使用道具]
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发表于 2014-7-5 16:58 资料个人空间短消息加为好友

小中大

你的问题后半部“先过色谱在酶切质谱鉴定"说得不够明确。别人不好理解你的意思。建议你把问题描述得详尽一些。
要做蛋白质鉴定首先是得到单一的蛋白。
在这前提下问蛋白质先酶切进行液相色谱-质谱鉴定与先过色谱在酶切质谱鉴定的不同，前半部先酶切进行液相色谱-质谱鉴定大家都能理解，也较常用。后半部，先过色谱是什么意思。纯化蛋白（与前提矛盾）？分离多肽（就不用酶解了吧）？难道是做PMF？然后做PSD?

plaa[使用道具]
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发表于 2014-7-5 16:58 资料个人空间短消息加为好友

小中大

问题应该是这样：蛋白质组学研究中，蛋白质混合物可酶切成多肽后经液质联用分离鉴定，也可用液相色谱柱分离后，每一组分再酶切后用质谱鉴定，分析两种分离鉴定方法在蛋白质组学研究中的各自特点。
协和期末考试题，高手不吝赐教。

hold住[使用道具]
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发表于 2014-7-5 16:58 资料个人空间短消息加为好友

小中大

楼主的问题，其实还是比较清楚的。
基于peptide的分离与基于intact protein的分离都是比较成熟的方法，各自都有很多的paper发表。
基于peptide的分离比较通用，与样品关系不是很大，
但是基于protein的分离能够得到更多的信息，如丰度等，但是有些样品会受到限制，如膜蛋白等，虽然有很多改善的办法。
其实，在很多paper中，特别是做protein profile的工作中，两者经常起互补的作用。
如：

附件

2014-7-5 16:59

80027800.jpg (79.97 KB)

baidukk[使用道具]
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发表于 2014-7-5 16:59 资料个人空间短消息加为好友

小中大

QUOTE:

原帖由 hold住 于 2014-7-5 16:58 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

楼主的问题，其实还是比较清楚的。
基于peptide的分离与基于intact protein的分离都是比较成熟的方法，各自都有很多的paper发表。
基于peptide的分离比较通用，与样品关系不是很大，
但是基于protein的分离能够得到更多的信 ...

太谢谢啦！
我是学临床的，这门课对我来说太高深了，真后悔当初自不量力啊！
那我是不是把您的话和这个图翻译一下就可以回答这道题了？好像主要是用的方法、流程和搜索的数据库不同。
再次感谢！

hold住[使用道具]
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发表于 2014-7-5 16:59 资料个人空间短消息加为好友

小中大

其实这样的题目，也没什么标准的答案。
要不你就以某一篇paper举个例子来说明这个问题。
但是搜库软件是可以自由选择的，一般按质谱仪来定。
p.S: 是哪位老师在蛋白质组学的课？
协和的高友鹤老师最近在该领域大作不断啊~~

baidukk[使用道具]
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发表于 2014-7-5 17:00 资料个人空间短消息加为好友

小中大

是赵晓航、李智立、李伏欣、彭小忠、朱大海、高友鹤、蒋澄宇等老师

baidukk[使用道具]
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发表于 2014-7-5 17:00 资料个人空间短消息加为好友

小中大

可惜自己不争气，很多东西听不懂。惭愧！
不好意思，能介绍篇paper读一下吗？
还有2道题，能帮我分析一下吗？~~
1、当前等电聚焦和凝胶电泳可用于蛋白质组的二维分离，它们是否可用于蛋白质组酶切后多肽混合物的分离，说明理由。
2、现在蛋白质在质谱鉴定前需要酶切成多肽，是否可以不进行酶切直接进行质谱鉴定，说明原因。
第1道题我觉得是不可以，因为多肽混合物很复杂，难以在等电点和相对分子质量方面产生差别。对吗？
第2道题我也觉得不可以，但不知该如何说明理由。
谢谢！！真麻烦您啦！