小中大Varian核磁二维谱的设置及其数据处理 Varian核磁共振二维谱的设置及其数据处理
答案一：常用参数及步骤:
COSY: 作氢谱，选好谱宽输入movesw,gCOSY,改ni=200or256,设定nt
NOESY:作氢谱，选好谱宽输入movesw,测90度脉冲，输入NOESY, ni=512, gain=38,nt? mix=0.5-0.8(分子量小于400或600的小分子设定mix=0.8左右，大
分子mix=0.5or0.6)
HSQC:作氢谱，选好谱宽输入movesw,测90度脉冲，输入gHSQC, ni=256, gain=38, d1=2, nt=? j1xh是根据分子结构查参考文献的，默认值140，我一般
不改的，对于五元芳杂环设定j1xh=160-200，如果氨基酸之类修改j1xh等于H-N耦合常数和其他参数可以得到H和N的HSQC图
HMBC: 作氢谱，选好谱宽输入movesw,测90度脉冲，输入gHMBC, ni=512, gain=38, d1=2, nt=?
注意90度脉冲宽度为H 而不是 C，还可以考虑设置ss=32来给仪器热身一下
答案二：
很多时候取决于具体的样品吧。以小蛋白为例，~10kDa, 1mM。
HSQC: 首先你要保证一维谱图足够清晰。nt>4, 一般你要保证s/n足够大。dsn会告诉你sn的值。我用的是500MHz, sn>70, 300MHz, sn=70*(300/500)^3/2.
对于溶剂峰，可以考虑用watergate除去。
j1xh可以去查，N-H ~95Hz, Ca-Ha 140Hz, 剩下的自己google一下吧。
混合时间=ni/sw1, 如果你需要indirect dimension很精确的话，就要设置ni比较大。 一般蛋白的混合时间〉10ms, 大蛋白由于驰豫的原因，混合时间更短。
拿到数据后，我一般用nmrPipe去处理，linux下的免费软件，很好用。通过zero filling 和 应用 window function, 可以有效的增加解析度。另外如果你只进
行F1维FT变换，可以看到你在F2维，fid是否衰减到0。根据这个你可以决定增减ni.
[ 本帖最后由 出国吧 于 2010-10-4 15:58 编辑 ]
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