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标题:【讨论帖】定量PCR实验技术分享(解答定量问题)

JK.jon[使用道具]
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21
 
1. 应该在同一批跑比较好。这样可以消除仪器在两批之间的控制差异。当然这个必须保证目的基因与看家基因的运行程序是一样的时候。
2、没有意义。因为你不知道你加入的。做了看家基因之后即可以看到实验组和对照组中这个数目的比例。

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我说的delta Ct 指Ct(目的基因)-Ct(看家基因),这样不是就避免了“cDNA模板是否来自相同数目的细胞的RNA所反转录来的”这一问题吗?即delta Ct 是目的基因相对看家基因的值,然后比较病例组与对照组delta Ct的差异有无统计学意义(不用2-delta delta Ct 计算表达的相对倍数,我觉得非检验科的算出来没意义),这样不就可以说明两组表达有无变化吗?
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大脑门儿儿[使用道具]
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ROX用来消除光程差,好像也有可能

不知道你从哪里看到需要先95度?图上的位置应该也不是95度。
这是我在程序运行的时候
instrument里面有个sample的温度,还有block的温度等信息
图上的位置为扩增45个循环后准备开始做融解曲线
此时sample 温度增为95度,持续10s
然后从60开始

还有几个问题,
Rn是什么意思
delta Rn又是什么,好像delta Rn的值是荧光量的lg值
还有,四个虑光片是什么作用
以哪个为准,总荧光和这又是什么关系

最近在用计算机程序模拟real-time的数据处理
不知道他是怎么通过检测的荧光值划出的扩增曲线
谢谢
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yapuyapu[使用道具]
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请问:
PCR效率的合理波动范围为?
谢谢!
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tie8[使用道具]
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请教:
       荧光定量PCR的基线,是怎么确定的呢?初学者,望有较详细解析。谢谢大侠!
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viviwang1987[使用道具]
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您好!
我想请教你一下
DNA原始拷贝数的作用是什么呢
怎么通过它来建立与疾病的关系呢?
谢谢
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ha111[使用道具]
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请教:
荧光定量PCR的基线,是怎么确定的呢?初学者,望有较详细解析。谢谢大侠!
基线就是背景值,因此就是曲线在没有“起跳”之前的一段。在软件上有一个地方可以输入
baseline从第几到第几cycle作为基线。设置原则是使没有起跳之前最多的cycle的信号接近0。
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挖挖挖[使用道具]
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27
 
您好!
我想请教你一下
DNA原始拷贝数的作用是什么呢
怎么通过它来建立与疾病的关系呢?
谢谢

=========================================================================================================

举个例子,可以测定血液中HBV DNA的拷贝数,这样就可以知道乙肝患者体内的HBV的浓度。
此外如果测定cDNA的时候,可以用来研究目的基因mRNA在正常样品和疾病样品中的表达差异,这样可以研究疾病与某个基因的关系。
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挖挖挖[使用道具]
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28
 
ROX用来消除光程差,好像也有可能

不知道你从哪里看到需要先95度?图上的位置应该也不是95度。
这是我在程序运行的时候
instrument里面有个sample的温度,还有block的温度等信息
图上的位置为扩增45个循环后准备开始做融解曲线
此时sample 温度增为95度,持续10s
然后从60开始

还有几个问题,
Rn是什么意思
delta Rn又是什么,好像delta Rn的值是荧光量的lg值
还有,四个虑光片是什么作用
以哪个为准,总荧光和这又是什么关系

最近在用计算机程序模拟real-time的数据处理
不知道他是怎么通过检测的荧光值划出的扩增曲线
谢谢

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有些仪器在做溶解曲线之前推荐先加热到95度,是让产物完全解链之后,然后降到60度后再重新结合,这样让产物双链尽可能结合。
之所以荧光值会升高,其实不是在95度的时候升高,而是到了60度的时候测定的荧光值升高了。具体是因为在扩增的时候测定荧光值都是在72度延伸之后测定荧光的。因为60度比72度低,60度的时候双链结合更加完全,这时候结合了更多的SYB GREEN I.因此荧光曲线上升。

Rn是第n个循环的荧光值,delta Rn你说的是正确的。
四个率光片,每个滤光片让一种荧光染料发出的荧光通过。如果你想在一管里头同时检测四种不同的模板DNA的数量,这样就可以用四种荧光染料标记的探针(taqman探针)来检测。一种探针对应检测一个模板DNA。一般没有人关注总荧光量。

扩增曲线是在第n个循环72度扩增之后测定荧光值作为Rn。然后将每一个循环的数据点连接起来就是扩增曲线了。
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挖挖挖[使用道具]
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xiang1x wrote:
请问:
PCR效率的合理波动范围为?
谢谢!

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这个具体的范围我还真不知道,应该没有一个明确的范围。但是越接近3。322说明扩增效率越接近2。
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谢谢指点
让我豁然开朗

那是不是sybr染料主要就是对应于b虑光片呢
分析主要用b虑光片的荧光值?

还有,用不同的试剂盒,作出来的Tm值有些会差距1度左右
请问这是怎么回事,产物应该是同一个
我用takara和普通的pcr试剂盒做出来是一样的
但是用理生的real试剂盒做出来是少1度的
觉得有些奇怪
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