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标题:【讨论帖】定量PCR实验技术分享(解答定量问题)

ladyhuahua[使用道具]
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请问,我用质粒DNA做标准曲线,R^2值总是
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请问:为了节省金费,本人用了25ul反应体系,但在软件输入反应条件时却忘了更改(50ul)不知对实验结果是否会有影响?
谢谢!

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问题应该不大,输入反应体系体积我个人认为是PCR仪用于计算控温的时候能够更加准确地测定反应体系中的温度。但是25ul和50ul之间产生的温度差别对结果影响应该不大。
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thesthold的设置,
因为定量的基础是假设指数扩增期之前的扩增效率都是接近2的一个定值。所以设置thesthold一般设置在刚起跳不久,也就是比较接近于零的位置,软件有默认的thesthold,一般采用软件默认的就可以了。如果设得很高,这时候反应体系里头的一些资源已经处于短缺状态,扩增效率无法接近2。这时候就没有什么理论依据了。

     是不是手动设置有几条基本原则:基线盖过所有阴性曲线,基线尽量位置最低,尽量位于曲线拐弯处?
      为什么据此原则设置的基线与软件默认的不同呢?哪个更准确些?
      多谢指教!

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thesthold和基线是两个概念,注意区别。

指数扩增期有一段区间,这段区间内你都可以认为它的扩增效率都是一样的,所以thesthold只要设置不是太高,都是有理论依据的。
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我把模板做梯度稀释,为什么原始浓度的Ct值比1/10稀释的Ct值还低?

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这个的意思是原始浓度的Ct值数值比1/10稀释的大
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可是我前段时间做过浓度更大的样品,它的1/10稀释比这个样品的原始浓度还大,跑出了很低的Ct值,所以按理论,这个样品应该能得出对应的Ct值啊。

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这个“很低的Ct值”是指数值低
不好意思,我把它们弄混了
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fei1226com[使用道具]
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我是在别的实验是做的,没有拷到SDS软件的,只拷回了扩增曲线,没有融解曲线。请您看看这个扩增曲线图。 PCR产物是161bp
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lagua123[使用道具]
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我是一个新手,我们实验室没有做定量的仪器,是去别的实验室做的。那个实验室软件没有备份,所以我没有找到SDS软件(仪器是ABI7900HT)。请教各位,最后我要拷回什么一些数据或图来分析啊?没有找到SDS软件(仪器是ABI7900HT)。这次我只是把各个反映管的CT值,扩增曲线图,标准曲线图拷回来了。谢谢!
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QUOTE:
原帖由 fei1226com 于 2014-7-27 17:33 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

我是在别的实验是做的,没有拷到SDS软件的,只拷回了扩增曲线,没有融解曲线。请您看看这个扩增曲线图。 PCR产物是161bp

请贴上Rn Vs Cycle的曲线,这样看起来方便一些。
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ladyhuahua[使用道具]
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帮我看看我的图图吧 以前的还可以总是觉得不理想 所以重新设计了引物,谁知道却是这个样子的,急啊愁啊 我用的是SYBER GREEN I 用的是strategene的仪器,做的是半定量 一步法 直接用的RNA做的模板。
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utt0989[使用道具]
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请教各位:
我想做真菌定量PCR,那标准曲线的需要的真菌菌液有标准品吗?需要自己配制吗?比浊法怎么做?谢谢
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