小中大thesthold的设置,
因为定量的基础是假设指数扩增期之前的扩增效率都是接近2的一个定值。所以设置thesthold一般设置在刚起跳不久,也就是比较接近于零的位置,软件有默认的thesthold,一般采用软件默认的就可以了。如果设得很高,这时候反应体系里头的一些资源已经处于短缺状态,扩增效率无法接近2。这时候就没有什么理论依据了。
是不是手动设置有几条基本原则:基线盖过所有阴性曲线,基线尽量位置最低,尽量位于曲线拐弯处?
为什么据此原则设置的基线与软件默认的不同呢?哪个更准确些?
多谢指教!
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thesthold和基线是两个概念,注意区别。
指数扩增期有一段区间,这段区间内你都可以认为它的扩增效率都是一样的,所以thesthold只要设置不是太高,都是有理论依据的。