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标题:【转载】【讨论帖】snp、测序问题专贴

lxh031[使用道具]
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发表于 2014-7-29 17:43 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

我想做一个已知基因的 SNP 鉴定，用来检测此基因的单双等位基因表达状况，请问我该选择哪种方法？测序要测很多样吗？大概得花多少钱啊？比较弱，见笑了！
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sunbent[使用道具]
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发表于 2014-7-29 17:43 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


QUOTE:
原帖由 lxh031 于 2014-7-29 17:43 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

我想做一个已知基因的 SNP 鉴定，用来检测此基因的单双等位基因表达状况，请问我该选择哪种方法？测序要测很多样吗？大概得花多少钱啊？比较弱，见笑了！ ...


你是要做不同突变的表达情况吗？
不知道你们做了表达的数据没有，还有是基因多大
一般这样要对基因的启动子区、调控区和外显子区整体
重测序
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luoliqiong[使用道具]
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发表于 2014-7-29 17:44 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


QUOTE:
原帖由 sunbent 于 2014-7-29 17:43 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')


你是要做不同突变的表达情况吗？
不知道你们做了表达的数据没有，还有是基因多大
一般这样要对基因的启动子区、调控区和外显子区整体
重测序 ...


我要检测印记基因的单双等位表达状态
还没做表达，基因全长大概四五十万bp，
全长测序啊？？
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ero11[使用道具]
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发表于 2014-7-29 17:44 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
400-500k的基因不算大
你看看它的编码区有多大
先测编码区和启动子区
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avi317[使用道具]
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发表于 2014-7-29 17:45 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
400-500k的基因不算大
你看看它的编码区有多大
先测编码区和启动子区

==========================================================================================================


回到我的问题, 你是说我直接测序找杂合子吗 ?就靠测序的方法就可以检测基因的单双等位表达? 不好意思, 关于SNP 还不是很明白,看有人通过RFLP,,SSCP来检测基因的表达状态, 还得看看文献啊
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avi317[使用道具]
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发表于 2014-7-29 17:45 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
还是没明白你说的单双表达的意思
你是要提取ran，然后测cdna吗？
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发表于 2014-7-29 17:46 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
检测组织中某印记基因是父系表达还是母系表达，抑或双等位表达
我还不清楚该用什么方法做
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jkobn[使用道具]
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发表于 2014-7-29 17:46 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

这个如果有家系或是核心家系应该可以解决
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tangxin_80[使用道具]
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发表于 2014-7-29 17:47 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
国外相关的报道文献有吗
你们有什么组织？
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ROSE李[使用道具]
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发表于 2014-7-29 17:47 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
我是一个新手，想问一下我手头已有提好的血标本的DNA，要测某个基因的SNP位点，想用酶切的方法做。想请教一下，我一共要准备哪些试剂，怕到时东西不全，实验时间会影响，谢谢哪位高手指导！
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