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标题:【求助】有懂的朋友帮我看看这张图是什么问题?

dongdongqiang[使用道具]
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【求助】有懂的朋友帮我看看这张图是什么问题?

本人是分子实验菜鸟一枚,最近在做issr分子标记,现在进行到了筛选引物的阶段,但是问题重重难以在进行下一步了,大家给帮忙看看问题吧,我用的是mix.
图1


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2014-10-29 10:39
eric 2013-05-17 14hr 08min.jpg (15.76 KB)
 
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dongdongqiang[使用道具]
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这是我用9个不同的模板在第二次筛选引物,用的是用一条引物,我用的MARKER是100bp的,胶是2.5的,电泳时的电压是85v为什么我觉得跑的这个图分不开呢,跑了将近2个半小时呢?条带与条带之间就是挤在了一坨,是不是还可以分的开一些,我电泳了将近两个半小时呢,是什么原因呢?还有就是为什么有的带亮有的带弱?其中一条带还没有,是不是在往pcr管里加的时候就没加上?pcr是一锅p的,究竟是什么原因呢?
图2、


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这个为什么条带左低右高呢?是不是电泳槽的问题呢?如果是电泳槽就是硬伤了。。。9个不同的模板其中又是有两个模板没东西和第一幅图一样。有的条带是楔形的不是矩形,为什么呀?
我是新手,才做这个半个多月,很多东西不懂,希望大家指教,也可以给别的同样遇到此类问题的童鞋以前车之鉴。。。希望大家多提宝贵意见。。。在此先谢谢大家了。。。


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2014-10-29 10:42
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wood533[使用道具]
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说说你的实验目的先。我看你的图跑得可以了,完全可以分析就行了,不要太纠结一些没有意义的东西
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yueban-1147[使用道具]
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同样我也是做SSR  为何我就 绝大部分只有一个条带。。而你的条带这么多呢。搞得和酶切一样,你做的是什么物种???
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yueban-1147[使用道具]
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不好意思看错了 你是做ISSR  我还以为是 SSR
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yueban-1147[使用道具]
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我又个问题 SSR 可以很准确的知道在哪个染色体上。只要找到和SSR连锁的 表型 就可以确定控制该表型的基因在哪个染色体上。 但是ISSR 的引物 能知道在哪个染色体上嘛??我看了ISSR的原理 怎么觉得不能用来定位啊
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redbutterfly[使用道具]
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能不能倒过来放呢?
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dongdongqiang[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 wood533 于 2014-10-29 10:43 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
说说你的实验目的先。我看你的图跑得可以了,完全可以分析就行了,不要太纠结一些没有意义的东西

哦,好吧,我就是有一个玉兰种,虽然是一个种,但是不同的地方确有不同的花色,我想就是通过标记的方法看一下他们之间的遗传距离,遗传多样性之类的,有没有朋友做过这个呀?我在想是不是还要做液相分析什么的呀?
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dongdongqiang[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 redbutterfly 于 2014-10-29 10:44 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

能不能倒过来放呢?

呵呵,我以前咨询过这个问题,有的朋友说这是不成文的规定要倒过来放着看,但是我咋觉得正着放看顺呢?哈哈哈。。。
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