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标题:【求助】SMN1和SMN2的7号外显子sanger测序

caihong[使用道具]
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发表于 2014-11-28 22:55 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】SMN1和SMN2的7号外显子sanger测序

同源性太大，引物怎么设计合理，求大神（膜拜中！！）
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veiwu[使用道具]
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发表于 2014-11-28 22:58 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


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原帖由 caihong 于 2014-11-28 22:55 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
同源性太大，引物怎么设计合理，求大神（膜拜中！！）

序列呢？
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caihong[使用道具]
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发表于 2014-11-28 22:58 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


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原帖由 veiwu 于 2014-11-28 22:58 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

序列呢？

这个在ucsc和ncbi上都可以下到
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caihong[使用道具]
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 小中大


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原帖由 veiwu 于 2014-11-28 22:58 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

序列呢？

关键在引物设计
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tears[使用道具]
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发表于 2014-11-28 22:59 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
只有上面方框内序列有差异。
只能在这两个地方设计正反向引物了。
你设计下试试吧。


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2014-11-28 22:59
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newway[使用道具]
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发表于 2014-11-28 23:00 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


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原帖由 tears 于 2014-11-28 22:59 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
只有上面方框内序列有差异。
只能在这两个地方设计正反向引物了。
你设计下试试吧。

我感觉第一个框没法设计引物，第二可以设计AS-PCR引物，但是说实话特异性不高，会有非特异性扩增
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tears[使用道具]
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发表于 2014-11-28 23:00 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


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原帖由 newway 于 2014-11-28 23:00 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

我感觉第一个框没法设计引物，第二可以设计AS-PCR引物，但是说实话特异性不高，会有非特异性扩增

那就没有其他办法了，这两个基因高度同源。
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caihong[使用道具]
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发表于 2014-11-28 23:01 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


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原帖由 tears 于 2014-11-28 22:59 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
只有上面方框内序列有差异。
只能在这两个地方设计正反向引物了。
你设计下试试吧。

非常感谢。
————我现在有用MLPA做拷贝数，突变做起来样本不好收集，所以看看能不能Sanger直接测DNA
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