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标题:【求助】ABI step one plus Real Time 系统怎么设置双内参内...

applebook=213[使用道具]
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发表于 2014-11-29 10:02 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】ABI step one plus Real Time 系统怎么设置双内参内...


如题，近来看文献，用两个内参来做相对定量（比较Ct法）。请问ABI step one plus Real Time 系统怎么设置两个内参基因，得到的数据怎么处理，请大家多多指教，谢谢！
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xue258[使用道具]
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发表于 2014-11-29 10:02 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

具体要看ABI定量PCR仪自带的软件系统 是怎么设置操作的了， 至于数据处理他们的软件可以进行简单的数据分析，我知道Viia 7系统就可以
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applebook=213[使用道具]
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发表于 2014-11-29 10:03 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


QUOTE:
原帖由 xue258 于 2014-11-29 10:02 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

具体要看ABI定量PCR仪自带的软件系统 是怎么设置操作的了， 至于数据处理他们的软件可以进行简单的数据分析，我知道Viia 7系统就可以

谢谢您的回复，目前界面上只能设置一个基因作为内参，不知道这个系统能否设置两个内参，英文文献中提到用两个内参的算术平均数计算目的基因的相对表达量，但是本实验室的仪器跟文献提到的不一样，数据处理的方法也不具体
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发表于 2014-11-29 10:03 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
是的，用两个内参的算术平均数计算目的基因的相对表达量，得到的结果更加可靠，但我想重点不是在设置而是在使用数据分析方法（比如双Ct法）
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xue258[使用道具]
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发表于 2014-11-29 10:03 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
你们在做数据分析时，是直接在他们自带的软件上分析，还是把Ct值导出来自行分析呢？
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applebook=213[使用道具]
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发表于 2014-11-29 10:04 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


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原帖由 xue258 于 2014-11-29 10:03 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
你们在做数据分析时，是直接在他们自带的软件上分析，还是把Ct值导出来自行分析呢？

数据是Excel的格式，表中的数据已经由仪器自带的软件自动分析了Ct，△Ct和△△Ct的数值。按照您的建议，我可以在软件中把其中一个内参设置成reference gene，另一个内参设置成target,利用得到的Ct，自行运算（两个内参算术平均值，△Ct和△△Ct）得到相对表达量。您看看，这样可行吗？
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xue258[使用道具]
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发表于 2014-11-29 10:04 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

我觉得可以，拿到各自的Ct值，把握好2^△△Ct公式，是可以用excel里的函数公式计算出表达差异值的。
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