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标题:【求助】双酶切出来的片段比我的目的片段大

koook5695[使用道具]
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【求助】双酶切出来的片段比我的目的片段大

这是我连18T载体和28a载体的图 但是我的目的条带只有720左右的bp  并且我用质粒做了pcr 条带也在720 但酶切的产物却在750处  什么原因啊  急!!
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rxcc33[使用道具]
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貌似720和750从电泳图上看也分不了那么清吧~
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pulala[使用道具]
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确定吗?30bp的差别可以准确看出来吗?
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join[使用道具]
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没事的,一般都会有误差,应该是正确的,直接拿去测序即可,或者菌液pcr,直接用你设计的原核表达的带酶切位点的引物p。
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koook5695[使用道具]
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原帖由 join 于 2015-1-13 17:43 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
没事的,一般都会有误差,应该是正确的,直接拿去测序即可,或者菌液pcr,直接用你设计的原核表达的带酶切位点的引物p。

测序不正确 只有30%多的一致性  我问过别人 有人怀疑说是连接上非特异性片段了
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koook5695[使用道具]
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原帖由 koook5695 于 2015-1-13 17:44 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

测序不正确 只有30%多的一致性  我问过别人 有人怀疑说是连接上非特异性片段了

那就是引物特异性的问题了   
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koook5695[使用道具]
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pcr产物胶回收 可以直接测序的
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koook5695[使用道具]
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原帖由 koook5695 于 2015-1-13 17:45 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
pcr产物胶回收 可以直接测序的

引物特异性不好 怎么办  还能做出来么
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koook5695[使用道具]
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原帖由 koook5695 于 2015-1-13 17:45 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

引物特异性不好 怎么办  还能做出来么

1.条件优化   寻找最适Tm
2.重新设计引物    一次设计3对    提高成功概率
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toy[使用道具]
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同意楼上,直接将你酶切的产物割胶回收做PCR也可以试试。这样就可以鉴定你是不是连接了非特异性片段,然后再将PCR产物拿去测序。
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