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标题:【求助】关于大片段连接效率低的解决办法

小鱼鱼[使用道具]
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1
 

【求助】关于大片段连接效率低的解决办法

各位大侠:
       小弟初来乍到,不懂规矩,望见谅!
       最近做连接转化蓝白斑筛选,阳性结果很少,可能是连接效率低的原因。目的片段约1400bp,请问如何提高连接的效率?
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pou[使用道具]
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2
 
你问一下你们实验室有没有人跟你用同一个连接酶,他们用的效果怎么样,连接酶会对连接效率造成很大影响;
其次在凝胶回收那一步要做好,如果回收的不好的话也会使连接效率变低。我用的是biomiga公司的回收试剂盒,效果还行。1400bp的片段应该算不上大片段,我做的是3000bp的片段
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小鱼鱼[使用道具]
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他们有用同一种酶连500bp左右的片段,效果还可以。不知你们用的是什么酶啊?
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pou[使用道具]
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高保真的PFU酶,北京全式金公司的,载体用的是配套的T-easy
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小鱼鱼[使用道具]
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5
 
我用的是tiagen的T4DNA连接酶,配套的pGM-T,这个不行吗?
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我也不清楚,PGM-T的载体我用过,但是用的不是你前面的酶,应该是和这个载体配套一个公司的酶,具体哪一种我也不太清楚了,不好意思哦
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小鱼鱼[使用道具]
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7
 


QUOTE:
原帖由 pou 于 2015-4-2 15:18 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
我也不清楚,PGM-T的载体我用过,但是用的不是你前面的酶,应该是和这个载体配套一个公司的酶,具体哪一种我也不太清楚了,不好意思哦

嗯,没事。
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yes4[使用道具]
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8
 

我也遇到了相似的情况,我的目的片段是4000多大小的,载体是PMT/V5,3000多,连接了好几次效率都很低,用的是T4连接酶,这次出来张的斑很少也,以前的几次都不长斑的……
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yonger[使用道具]
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9
 

用好一点的连接酶吧
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chengjie79[使用道具]
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10
 
我也是 就是连接不上 排除了很多方面 我没有凝胶回收 而是酚氯仿纯化 一直连不上 质粒也验证切开了 出来的菌做菌落PCR电泳验证条带位置就是空质粒
快郁闷死了
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