液质联用

有建立LC/MS谱库的朋友吗？能否谈谈在建立过程的心得，建成的谱库有实用性吗？

有一定的参考价值，但实际意义远不如气质。因为气质所有厂家的离子化石一致，且离子化本身对质谱图没有影响，所以谱库非常有参考价值。
    但是，液质离子化条件对质谱图的影响非常大，因此离子源的状态对你的结果非常重要。所以，你每次做样，条件如果不一样，匹配率就不可能高，谱库的参考价值就不大了。
    说句不好听的，你花那么大劲做谱库，还不如自己的大脑记住某些物质峰的特征（或用纸打印出来看的方便）。

正如楼上所述，液质数据库的通用性不是很好，但也不是没有价值，至少在你自己的机器上建立的数据库可以应用同一品牌的大部分仪器。
我现在正在建立中药成分的质谱库，目前已经建立了大约100多种，至少到现在为止我通过建立这个数据库可以使我的工作收到以下便利：1. 对中药常见的结构类型可能的质谱条件有了一个预判。 2 对中药化学成分定量研究中内标的选择有了第一手的资料。 3. 增加了对未知化合物的鉴定几率。4. 看着自己手里那一本本的原始记录，满足啊，自豪呀！所有的化合物都是自己一步步从称量，到逐级稀释，再到测定（每个化合物通常需要30-60min），最后记录打印，很是艰辛啊

谢谢楼上的朋友。不知二楼是用什么仪器建立的，我用安捷伦离子阱仪器在建立的时候，就发现重现性不好，特别是二级，如果仅仅是用流动注射来建立谱库，情况好一些，但又失去了一定的实际意义。确实也如一楼的朋友所说，不可能每次做样条件都是完全相同的，所以会碰到有时有些特征碎片很小，有时又出现加合，这样匹配度就不好了。

Thermo Fisher Scientific的质谱仪上应客户需求，有的配备了Mass Frontier辅助结构解析软件，类似于楼主所说的LC/MS谱库吧。在学校做学位论文的时候，用LC/MS来鉴别中药化学成分，跟3楼老师讲的有几分相似。呵呵。。。

转个相关的帖子到这儿：
液质联用鉴定中药化学成分的思路
转自丁香园，作者：xubeibei

关于液质联用鉴定中药化学成分，我是按如下的思路进行的：

1 确定所研究中药的原植物来源，尽可能把该植物已知的化学成分的结构、质谱数据、UV数据收集完全。必要时收集整个属的化学成分的相关数据。
2 进行LC-MS正负离子切换一级质谱检测。目的：确定分子量。仅靠一种离子模式检测确定分子量并不是很可靠，除非在正离子模式下同时观察到[M+H]+,[M+Na],[M+K]+峰。根据依次相差22，16可以确定分子量。
3 结合DAD所得紫外图谱特征，确定化合物大概类型。
4 进行多级质谱检测，根据裂解碎片，确定分子中可能含有的碎片，结合分子量和生源，如果是已知化合物的话，至此基本可以归属化合物。当然，立体异构体还无法归属。比如苷中糖的连接位置，甲基的取代位置还是很难确定的。
5 如果能做LC-TOF-MS，或者其它高分辨率MS，得到分子式的话就更好了。
6 必要的时候对于立体异构体采用反应质谱法试一试。
7 根据初步鉴定结果，购买可能的化合物标准品，进行对照实验。
一点感想：
1 我国的液质仪器目前肯定是不少了，但是充分发挥作用的还是少数。许多仅仅用来定量，有的甚至仅仅摆放着。
2 离子阱质谱比较便宜，而且能做到10级左右，非常适合结构研究。
3 可惜的是目前关于负离子裂解规律，以及离子阱质谱中裂解反应的规律认识还不够。不像EI，早已可以进行计算机辅助鉴定，软电离质谱目前缺乏标准数据库，对于结构确定来说是个困难。
4 液质毕竟还是比较昂贵的仪器，通常有专人管理，所以利用者通常不是操作者，再加上国人合作精神差，所以常常不能发挥仪器的潜力。

转自丁香园，作者：Kinginsun
同感！
1、不同型号的质谱有不同的优势，比如离子阱、TOF、FT-ICR的主要优点是定性，让它们作定量，效果肯定不如Q-Q-Q;反之亦然。
2、离子阱的理论是可以做到10级，但根据化合物的不同，有些做到3-4级以后，很多就没有信号了；现在我还没有遇到可以做到10级的化合物。
3、软电离质谱的一个最大缺点（也是优点）就是裂解能量不固定，不同厂家仪器，不同试验时间的重复性差；但其涉及的裂解规律应该比EI简单的多，主要为中性丢失反应，而为什么大家说难呢，一方面是前面说的原因，还有一个就是xubeibei提到的负离子谱。
现在已经有了一些技术可以控制谱图的重现性，估计ESI谱图库的出现不会太远了！
4、这个不是技术问题啦，呵呵。

作者：troy.tper.lee
关于上面谈到的，简直是一直在梦想的。但就现在的形势看，官方要出材料（例如像国标一样的东西）还是要有一段时间的积累和孕酿才行。
1）质谱仪型号类别相差太大了，化合物种类又超级繁多，很难统一标准。各种不同型号仪器即使作同一类化合物可能裂解上都有所差别，尤其是一些多肽类药物。我曾经在安捷伦6410上作过一个小肽，在API3200QTRAP上碎片离子完全不同。
2）现在好多地方单位在筹划建一些库，尤其是结合一些仪器公司共同完成。比如看到过一些关于中药单体裂解方面的试验，还有化药中毒药物库，农药库，食品等。我自已在使一个化学中毒急救库。也是在不段探索中。不过，这与裂解规律方面可能又差远了点。
3）软电离方面最好是先将一些正离子中特典型的库建起来，如加质子，再一步步完成。不过，这方面的文章也有了。我看到过三唑伦类裂解律论文。致于正离子化加铵、钠、负离子、多电荷等，慢慢总结吧。

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建立LC/MS/MS质谱库,正像前面几位讲的一样,可能会受流动相,离子式方式,以及不同型号仪器的影响,建立的质谱库没有统用性.
但美国应用生物系统公司的QTRAP系统上所建立的EPI(增强子离子扫描)质谱库可以在所有QTRAP系统(3200QTRAP,4000QTRAP,5500QTRAP)上应用,其重现性非常好,原因是这个质谱库是子离子质谱库而且灵敏度非常高,它不会受到流动相,离子化参数的影响,只要碰撞能量一样就有很好的重现性,目前EPI质谱库已经有超过去1800个化合物,里面主要分为三类,农药,兽药和管控药品.