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标题:同志们看过来看过来啦~·snp、测序问题专贴

飞天小鹿[使用道具]
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11个motif组成,每个motif的结构是20bp保守序列+(CA)n,变异类型是一个或几个motif插入或缺失

如何解决电泳拖尾问题

谢谢!
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格格巫[使用道具]
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请问各位大虾
1.知道基因和位点,如何查SNP的rs号码?
如知道PDE4D基因83T/C多态性,如何知道它的rs号码?
2.SNP后直接加个数字是什么意思?如PDE4D基因SNP41。知道PDE4D基因SNP41,如何查SNP的rs号码?
***!
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明天的明天[使用道具]
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求助!

我做家族遗传病的分子机制,已经知道相关突变位点。计划做真核表达质粒,观察迁移、分化、凋亡、周期等细胞改变,但感觉太没有新意,不知下

边还可以向哪些方向探究。

另外,我的pcr遇到麻烦,目的基因gc比例80%,用了GC Buffer虽然扩出来了,准备先连T载体再设计家酶切位点的引物二次PCR,但测序总是有烦人

的突变,测序也经常是两个方向不能同时测出,片段一个500,一个1500也不大啊。郁闷啊!三个月了载体都没有构建好!!!
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我的问题是我做人的MRP2基因C-24T多态性,用的是PCR-RFLP方法分型。采用引物是C24T Fw:5'-CTG TTC CAC TTT CTT TGA TGA-3'。C24T Rev:5'-TCT TGT TGG TGA CCA CCC TAA-3'。内切酶为BbsI,PCR产物长度为210bp。我的问题是不知道酶切反应之后,MRP2-c24t多态性的突变子是能被酶切开还是不能被切开?被切开的片段长度为多少?谢谢!

参考文献为Polymorphism of the ABC transporter genes, MDR1, MRP1 and MRP2/cMOAT, in healthy Japanese subjects.S Ito, I Ieiri, M Tanabe, A Suzuki… - Pharmacogenetics …, 2001。
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我的问题是我做人的MRP2基因C-24T多态性,用的是PCR-RFLP方法分型。采用引物是C24T Fw:5'-CTG TTC CAC TTT CTT TGA TGA-3'。C24T Rev:5'-TCT TGT TGG TGA CCA CCC TAA-3'。内切酶为BbsI,PCR产物长度为210bp。我的问题是不知道酶切反应之后,MRP2-c24t多态性的突变子是能被酶切开还是不能被切开?被切开的片段长度为多少?谢谢!

参考文献为Polymorphism of the ABC transporter genes, MDR1, MRP1 and MRP2/cMOAT, in healthy Japanese subjects.S Ito, I Ieiri, M Tanabe, A Suzuki… - Pharmacogenetics …, 2001。
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葡萄籽[使用道具]
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各位高手好!我是一名临床医生,对分子生物学几乎一无所知,目前要做关于基因筛查的课题。看了很多文献,仍然无法确定使用何种方法,请指教!

我研究一种常染色体隐性遗传疾病,国内的基因分析文献报道很少,国外文献较多。目前已定位的致病基因有15个,分布在不同染色体上,总共加起来204个编码外显子。

目前手上的先证者3个,好像都是独生子,临床上已诊断该病,需要对先证者和他们的父母做基因测序,期望找到新的突变。

国外文献上报道的方法很多,早期图位克隆、连锁分析,到现在的SNP探针基因芯片、genome-wide scans(全基因组扫描?),因为对这些方法不了解,对文献的理解也是一知半解,请大家帮忙出主意,谢谢!
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不懂[使用道具]
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请教一个问题,我克隆得到一段800多bp片段,连接转化,摇菌,菌液PCR鉴定与目的片段相符,将菌液取出一般送去测序,另一半菌液-80度保存,第一次送菌液的时候测序得到730bp,因为我的片段是800bp,还差70个bp,将另一半菌液送出去测序,结果却得到380bp片段,这么相同菌液两次测到的结果相差这么大?而且怎么每次都跟预期片段相差这么大?
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回复 #47 不懂 的帖子

这个我感觉是测序问题
你看看每次测序都能找到完整的载体序列的2端吗
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菠萝菠萝蜜[使用道具]
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各位老师,请教一个问题,用T7和Sp6对同一质粒测序经常是一个引物的测序结果很好,另外一个就很差甚至就没信号。最近老遇到这个问题。请大家帮我分析一下,谢了先。
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飞天小鹿[使用道具]
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请教一下,用Taqman法检测SNPs后,想送去测序。该怎么做啊?急,请高手指点。谢谢!
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