PCR仪

Bisulfite sequecing PCR(BSP)，它的引物一般不含CpG岛，这样以保证能同等扩增甲基化和非甲基化的模板，然后转克隆测序，一般来说，至少是10个克隆；如果你只有1％的模板发生了甲基化，那么你最少得挑100个克隆才统计到！而MSP的灵敏度可以达到0.1%(参考：Methylation-specific PCR: A novel PCR assay for methylation status of CpG islands)

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BSP的引物一般不含CpG二核苷酸，我们期望能它能同等扩增甲基化和非甲基化的模板，但理论上是不可能的，实际上也已经证明了这种不可能。因为甲基化和非甲基化的模板在处理后GC含量有显著差异。

而MSP的灵敏度可以达到0.1%(参考：Methylation-specific PCR: A novel PCR assay for methylation status of CpG islands)

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MSP的灵敏度可以达到0.1%和MSP的灵敏度是0.1%是完全不同的。
MSP的灵敏度可以达到0.1%，所以99%的甲基化和1%的甲基化，MSP的结果没有区别。而99%的甲基化和1%的甲基化，其生物学意义的重大差别是不言而喻的。
MSP的灵敏度可以达到0.1%，所以98%的转化率，给假阳性、假阴性结果提供了足够的空间。