【讨论帖】（表观）遗传学/转化医学 - 经验共享

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标题:【讨论帖】（表观）遗传学/转化医学

finger[使用道具]
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发表于 2015-7-7 17:14 资料个人空间短消息加为好友

小中大

好像C 峰就应该是蓝色的吧？ A是绿，T是红，G是黑啊。

txwuyan[使用道具]
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发表于 2015-7-7 17:15 资料个人空间短消息加为好友

小中大

我最近在做SET结构域基因进化分析。
我一直有个想法，不知道怎么样？
甲基化是靠某些基因甲基化，SET基因就是负责甲基化的基因，那么这个基因的表达高低就能体现到甲基化的程度，通过控制这个基因的表达（当然还有除甲基化基因），是否发现某些基因被甲基化调控呢？（调控SET基因，影响甲基化）。
不知道我这个想法合理吗？
这个只是我大概的想法，我现在主要在做SET结构域基因进化分析，毕业论文，谁做相关方面的研究我们可以讨论下。

bs4665[使用道具]
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发表于 2015-7-7 17:15 资料个人空间短消息加为好友

小中大

老师的思路很好，可是我想请教一下，用去甲基化药物处理后，恢复表达的基因可能有数百个，那样的话怎样去找出有用的抑癌基因的是需要把这样的基因都做RT-PCR在肿瘤组织和正常组织中验证然后再用MSP验证吗这样的话会不会很耗时？有什么好的方法因为刚刚开始接触表观遗传希望老师不吝赐教

yonger[使用道具]
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发表于 2015-7-7 17:15 资料个人空间短消息加为好友

小中大

我想向各位前辈请教一个极端幼稚的问题，请各位不吝赐教：外界或内部的环境导致了一个印迹基因的印迹缺失，那么我们通过药物或者其他手段干预，这个印迹基因会恢复吗？它恢复的周期可能是多长时间啊？再者，一个疾病它的某个基因的CpG岛甲基化异常，通过药物或者其他干预，这个甲基化的异常会改变吗？

dog002[使用道具]
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发表于 2015-7-7 17:16 资料个人空间短消息加为好友

小中大

目前我也在看dnmt1和组蛋白修饰对dna甲基化的影响，zeb据报道可以抑制dnmt1的表达，而tsa又是组蛋白去乙酰化抑制剂。所处理的细胞是植入前胚胎。初步预测它两是协同作用，共同去甲基化。
dna甲基化和组蛋白修饰之间的相互关系还没搞懂，而一定是神秘的联系着

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发表于 2015-7-7 17:16 资料个人空间短消息加为好友

小中大

对于yonger的问题回答：
印记基因形成于配子形成过程中，认为干预再恢复这似乎很难实现
通过药物改变甲基化很正常，外界环境很容易导致甲基化变化

txwuyan[使用道具]
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发表于 2015-7-7 17:17 资料个人空间短消息加为好友

小中大

表观遗传甲基化引起发育分化
那么从白细胞提取出的DNA得出的表观状态
应该不能反映其他组织某一个基因的表观遗传状态吧
假设这一基因在干细胞有表达合成某种蛋白质
而在白细胞不能合成

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发表于 2015-7-7 17:17 资料个人空间短消息加为好友

小中大

QUOTE:

原帖由 txwuyan 于 2015-7-7 17:17 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

表观遗传甲基化引起发育分化
那么从白细胞提取出的DNA得出的表观状态
应该不能反映其他组织某一个基因的表观遗传状态吧
假设这一基因在干细胞有表达合成某种蛋白质
而在白细胞不能合成 ...

DNA的不同甲基化修饰是导致组织分化的机制之一，因此，按理说不同的组织中至少组织特异性表达基因是应该具有不同的甲基化谱的。

zbboom[使用道具]
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发表于 2015-7-7 17:17 资料个人空间短消息加为好友

小中大

哈哈,我今年刚考上研究生，导师要我做表观遗传学方面的研究，原来还有这么多同道，搬个凳子占位

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发表于 2015-7-7 17:18 资料个人空间短消息加为好友

小中大

各位同行那位是在做全基因组甲基化分析的啊我最近就在做不同动物不同组织的全基因组甲基化分析想通过这个方法找到一些对一个性状有影响的基因不知道这样可行否请各位赐教

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