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标题:国内外SNPs研究的进展及展望 [转自 丁香园论坛]

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发表于 2011-8-15 17:15 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
请教大侠一个问题，SNP在同一个体的不同时期也可以有吗？
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发表于 2011-8-15 17:15 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
这个讨论实在不错，我一路看来，受益匪浅。我一直在做SNPs的试验，现在要处理数据了，分析完病例对照的基因型分布后想再进行haplotype分析，却苦于相关知识所知太少，希望各位高手上传一些haplotype的知识，先谢谢了！
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发表于 2011-8-15 17:15 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
值得探讨--但在法庭科学的价值现在认为应用价值不是太大,可能有点过热!
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发表于 2011-8-15 17:16 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
你好我也正准备做snp，准备做几个位点，然后做单体型分析，但是看了一些文献上写,要做连锁不平衡分析，然后使用什么phase program 构建单体型，说实在的不会用，我最近下载了个haploview，但是还不知道如何构建单体型，建议你也先去下载个，估计到时候用的上，我现在不知道到哪里下载那个什么的phase program.
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发表于 2011-8-15 17:17 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
我本来没打算进行haplotype分析，一个在国外的老师看了，他主张分析分析，数据他已经分析过了，要我下结论，我却对haplotype了解很少，你那里有haplotype的相关文献吗？
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发表于 2011-8-15 17:18 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
我这里有部分，其实你可以先到人类单体型计划的官方网站去了解下单体型计划到底是什么，网址是cuturl('www.hapmap.org')，有中文版的，然后选择project information 可以有个初步的了解，然后到pubmed 上去找相关的文献吧，我现在也不知道如何构建单体型，似乎要做位点之间的连锁不平衡分析，计算ＬＤ值之类的，现在正在做实验，还没写文章，也没有好好研究到底怎么做，只是构思了下，不过实验已经让我很郁闷了，有机会多指点指点我啊！
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发表于 2011-8-15 17:19 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
我也是做多态性关联的，可是我不知道从哪儿下手，真的很郁闷！不过看了你们的帖子，心里好受多了
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发表于 2011-8-15 17:19 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
SNP研究是随着human genome project的发展而发展，随着International HapMap Phase I/II的完成而不断完善。目前SNP的研究已经逐渐促成了一个新的产业，预计几年内会形成10亿美元的产值。

我也准备陆续给大家介绍一些好的文献，以期通过大家的讨论，提高对SNP研究的兴趣和认识。
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发表于 2011-8-15 17:19 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
向大家推荐一个检测大样本量的SNP位点的新技术平台--sequenom。利用质谱技术，通过“称量”寡核苷酸的分子量来分析SNP。适用于对样本数很大，但筛查位点相对较少（几百个）的研究。大家可以上网搜一下这个技术。
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发表于 2011-8-15 17:20 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
sequenom有几个缺点
1、成本偏高
2、它只能做hapmap数据中80%的数据
3、他的成功率也大约是80%

还有他要是坏了修起来很麻烦
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