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标题:有关SNP，超强技术，需要帮助的请进[转自 丁香园论坛]

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发表于 2011-8-16 16:26 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
是想做PCR－RFLP么？给大家一个很方便的online分析E切的website－－－cuturl('http://watcut.uwaterloo.ca/watcut/watcut/template.php')，
可以专门针对PCR－RFLP寻找酶切位点，只需要输入Rs号即可得到合适的内切酶，如下图所示，你可以选择BslI或者DraIII作为内切酶。


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2011-8-16 16:26
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发表于 2011-8-16 16:27 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
这个网页真不错，不过我们已经全作测序了
收藏先~~~~~~~~~~
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发表于 2011-8-16 16:28 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
我想问一些问题：我使用DraⅢ进行酶切，得到的片段分别为48bp和83bp，这样两个片段行电泳可以分辨清楚吗？
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发表于 2011-8-16 16:29 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
建议你重新设计引物，这样的片段很难，特别是有引物二聚体的时候
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发表于 2011-8-16 16:29 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
在椎间盘组织中可以提出DNA，进一步做SNP吗，拜求赐
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发表于 2011-8-16 16:30 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
这个SNP的引物已经是有资料提供的了，我是根据该引物的位置和DraⅢ酶的酶切位点来计算得到的48bp和83bp这样两个片段，这样两个片段跑电泳时是不是很难区分？
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发表于 2011-8-16 16:30 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
去年参与过一个课题,先用SSR,然后用SNP,不过没来得及做到SNP部分就换课题了。但是对这方面有兴趣，有很多疑惑：
据我所知，SSR和SNP为寻找遗传标记方面常用的两种技术（只是出现时间上一个早些，一个晚些而已），都需要在测定大量样本的基础上分析、验证。有好多报道中认为SNP比SSR更优越。也看过一些零碎的材料总是不够系统。所以，我想请教下，二者在技术原理、实验材料，技术程序以及应用方面是怎样的以及他们的异同。
谢谢！
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发表于 2011-8-16 16:31 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
ssr是基于第二代遗传标记物str的基础上
一般用于家系分析和物种比较
snp可以说是第三代遗传标记物，是基因组遗传突变的基础
一般用于关联分析

实验材料都是DNA，snp的检测方法可以有很多种，国外常用的
是探针芯片可以大量的检测SNP，单位成本较低
你可以去遗传板块，那有很多的帖子  
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发表于 2011-8-16 16:32 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
能不能详细介绍一下eQTL吗？
刚才查了一些文章，还不是很明白eQTL是个什么东西，麻烦介绍一下吧，
做这个东西似乎需要专门的仪器，一般的实验室是不是也没发做？
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发表于 2011-8-16 16:32 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
基本上是基于全基因组snp芯片和全基因组差异表达芯片的
的数据并行分析定位功能位点的方法
中文成为遗传基因组
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