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标题:有关SNP，超强技术，需要帮助的请进[转自 丁香园论坛]

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发表于 2011-8-16 16:32 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
截图：最简单是按下Print screen(prnt Scrn)键，打开画图或photoshop新建文件粘贴
或者你用傲游浏览器，工具里有屏幕截图，qq上也有截图工具。
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发表于 2011-8-16 16:33 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
FP-TDI(fluorescence polarization template directed dye—terminator incorporation)这种检测SNP的方法实施起来难度如何，哪里能做？知道了具体的位点怎样设计引物？谢谢指教！
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发表于 2011-8-16 16:33 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
请教如何来做某一遗传综合症的全基因组范围的DNA CNV？是否可以做某相关基因的CNV？谢谢。
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发表于 2011-8-16 16:34 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
To wwwwwwqqqqqq 92: FP-TDI我们没有做过，荧光偏振的试验比较精细，但适合高通量的筛选！
To 九天鹰：植物方面没有资料！sorry!
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发表于 2011-8-16 16:34 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
可以用snp芯片做全基因组cnv
现在做cnv一般3种方法taqman探针
snp芯片和mlpa
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发表于 2011-8-16 16:49 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
CNV的信息，你可以从UCSC genome网站上的得到。我们这边主要用illumina的SNPs芯片检测得到的，如果你需要，我也可以帮你看看特定基因的CNV信息，这个过程很快，很简单！
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发表于 2011-8-16 16:49 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
刚接触snp想问一下。一般的不是说在rRNA上用吗？测rRNA序列由于rRNA变化比较小，可以用来做进化树。其他的基因序列也可以找到？做什么用，还有就是SNP不是说一个核苷酸，而是几个一段的，这个是怎么分的？
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发表于 2011-8-16 16:50 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
SNP就是基因组上的改变，不是RNA上的
SNP就是指一个，但突变或是基因组改变还包括
其他的大段改变
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发表于 2011-8-16 16:50 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
问一下，PCR-RFLP中，PCR产物在酶切之前要不要纯化啊？不纯化能切的开吗？我的PCR片段304bp，切后片段分别为70 、130bp，内切酶（NEB的）也买到了，好多人都说要先纯化，那样很麻烦的，原来没想到还要纯化，因为突变率不是很高，又怕切不开不知道是产物的原因还是没有突变。请高手指点一下。
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发表于 2011-8-16 16:51 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
从哪里知道我现在这个SNP位点周围的基因示意图或者可能调控基因的示意图（不是原始的碱基序列），谁能教会我从哪里能看到基因序列的示意图？
在这个网页中， cuturl('http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_ref.cgi?rs=708692')。
reference NT_010755->NM_007144->
615245 reverse 1805 3' UTR
Celera NW_926828->NM_007144->
423100 reverse 1805 3' UTR
上面显示的是我这个多态性（SNP）的位点位于3' UTR的1805位置上。
在此，我不知道从哪里知道我现在这个位点周围的基因示意图或者可能调控基因的示意图（不是原始的碱基序列）。
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