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标题:※※※电泳讨论专区※※※

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请教:
我最近在做电泳,使用的是PCR扩增的产物,出现了下列问题:
1, 有脱尾现象
2。条带弯曲
3。产物在电泳30分钟之前是一条带,但之后就是两条带,而且两条带很接近
望多多指教

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脱尾有可能是做PCR时模板过多所致.条带弯曲有两个可能性一是胶没做均匀,二是电泳缓冲液离子浓度高了.产物出现两条带,是因为本来就扩增出来了两条带,经过较长时间电泳分开了.
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由于每次样本量大,现在将电泳槽由原来的一次跑16个(共两排,每排8孔的)改为每排15孔一次两排的那种,还是用的一样的浓度的琼脂糖(3%)和电压(120V,1h),现在的电泳很难看见清楚的条带,常常是片状拖带,不知各位高手有没有什么好办法?
还有今天30多个样本的PCR后酶切的成果全毁了,除了上面的电泳原因,还有就是酶切后的片断是134,125,89,56,11,用了3%的琼脂糖也不能分开,我都快急死了,有谁支招没有?
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我想请教个问题,我用分子克隆上的碱裂解法提质粒后,跑电泳是经常是条带出不了孔,为什么??
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我提了质粒DNA,在PCR之前想看看分子量是否是我所要得,但出现一个问题,必须要和loading buffer按至少3:1,严重时1:1的比例上样才行,否则就会出现漂样。求助。
buffer没有问题,用来上marker5:1没问题。

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可能是质粒DNA的纯度不够高。
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(2)是因为电泳过程中产热所至。有两种方法解决:一是降低电压,延长电泳时间,使单位时间内的产热量减少;二是在电泳槽外放两个冰袋,物理降温,电泳过程中可更换冰袋,效果也是不错的。
(3)我做变性PAGE时没有做过预电泳,结果也很好。可能对实验影响不大吧。

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预电泳的作用在于消除缓冲液前沿的影响。肯定有用。
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1.如果是同管扩增,因为引物之间有竞争,各基因的扩增效率不同,所以需要重新调整体系。你的基因比较多,都在一管里扩的话,估计调整会比较麻烦,所以不妨单扩每个基因,然后一起电泳。
2.等量混匀上样即可。

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这种方法并不可行,理论上可以。如果用EB显色,前面的条带对后面的有很大的影响,谈不上定量。分开电泳是可以的。
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我想请教个问题,我用分子克隆上的碱裂解法提质粒后,跑电泳是经常是条带出不了孔,为什么??

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可能是操作有问题。找个有经验的老师带几次。没出孔的条带应该是细菌的基因组DNA.
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由于每次样本量大,现在将电泳槽由原来的一次跑16个(共两排,每排8孔的)改为每排15孔一次两排的那种,还是用的一样的浓度的琼脂糖(3%)和电压(120V,1h),现在的电泳很难看见清楚的条带,常常是片状拖带,不知各位高手有没有什么好办法?
还有今天30多个样本的PCR后酶切的成果全毁了,除了上面的电泳原因,还有就是酶切后的片断是134,125,89,56,11,用了3%的琼脂糖也不能分开,我都快急死了,有谁支招没有?

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这么短的片断最好用变性的12%的聚丙稀酰胺凝胶电泳。
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脱尾有可能是做PCR时模板过多所致.条带弯曲有两个可能性一是胶没做均匀,二是电泳缓冲液离子浓度高了.产物出现两条带,是因为本来就扩增出来了两条带,经过较长时间电泳分开了.

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先问清楚条带的位置再回答问题。这样说没有充分的依据。
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新手,请指教,为什么我的琼脂糖凝胶电泳的条带总是会斜,是缓冲液的问题还是电泳仪的问题????

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我说一个别人没说的原因:电泳槽不是水平的,不信试试看。
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