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首先,我认为引物设计的重要性要高于PCR条件的摸索;如果说你的这个PCR条件有什么要摸索的,我想,既然现在没有产物,那退火温度往低了调,先不管特异性,先有东西再说,有了产物,特异性不好,再考虑温度高一点,如果退火温度降下来也没有产物,那就要考虑试剂等原因了。
其次,不清楚你扩增的什么模板,看前面的帖子,应该是人基因组吧?我以前做过Taq酶质量控制,一般公司的普通Taq酶扩增人基因组到2k多大小的片段已经接近极限了,也就是说处于扩增出来和不出来之间,条件稍微不好就失败,所以Taq酶质量在你的实验中应该比较重要。
另外,引物我只是建议贮存液用TE溶,工作液如果也用TE溶,既要顾及到PCR体系中加入引物的体积,不能太大,否则引入太多EDTA,会螯合镁离子,抑制PCR。
最后,引物设计的好坏,可以用oligo6.0评价一下。