小中大【求助】5‘RACE 紧急求助
本人3’端已经测出来了,现在做5‘端,却怎么也扩不出来。5'RACE做了两轮pcr,用的都是以下程序:即1、94度2分钟。2、94度30秒,72度3分钟,5cycle。3、94度 30秒,70度30秒,72度3min,5 cycle。4、94度30秒,68度30秒,72度3分钟,25cycle。最后,72度7min延伸。(这个是BD公司提供的程序)
做第一轮pcr的时候有条带,但是鉴定不是我要的。第二轮pcr的时候好像隐约有目的条带,但是不亮,很微弱。对了,我把第一轮的产物稀释了100倍,第二轮成糊状。
内外2个引物的TM值设计的时候都接近70度,按照要求设计,可是合成出来后引物单子上是63.62度。
是不是程序不合适?
请各位给一些建议,本人在此谢谢大家啦。