小中大待测样本基因表达差异分析原始数据
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我最近在做Real-time PCR 相对定量基因表达,我用的是AppliedBiosystem 公司的机器和软件,我有一个问题想请教您一下:
比如我做不同时间点 0h, 3h,6h, 24h 的某个基因表达量的相对变化,也就是说以0h为calibritor, 3h,6h, 24h 相对0h 的变化量。一般每个时间点设三个重复,但是三个重复的样品的值不可能是完全一样的,有时候差异还很大,在分析时是选 0h-1, 0h-2, 0h-3 三个样品中的一个作为calibritor , 也就是设它的值为1,其它两个的值可能大于1 也可能小于1 ,假设0h-2为 0.7 ,0h-3为1.2, 那么,如果我选0h-2 为calibritor , 也就是设它的值为1,那么实际上其它所有样品的相对值都升高了,同样,如果选0h-3 为calibritor , 也就是设它的值为1,那么实际上其它所有样品的相对值都降低了。那么我的问题是到底选哪个作为calibritor 呢。多谢了!