[讨论]做完荧光定量后如何统计数据 - 经验共享

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标题:[讨论]做完荧光定量后如何统计数据

橘子水儿[使用道具]
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发表于 2011-9-2 16:46 资料个人空间短消息加为好友

小中大

看了上面的帖子，受益匪浅，我还想再问一句：用2－△△Ct处理数据，最后用什么方法进行统计学分析？若癌和癌旁配对的两组数据，癌旁为1，癌中表达量为癌旁的2－△△Ct倍，可以进行计量资料的t检验吗？

微笑的海豚[使用道具]
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发表于 2011-9-2 16:47 资料个人空间短消息加为好友

小中大

②2－△Ct法应用举例：测定Jun基因在某因子作用前后的表达变化

假设扩增效率（E=10－1/斜率）为2（即每个循环模板量翻倍）
比率（处理后/处理前）＝2 － Ct（处理后）－Ct（处理前）
＝2 － △Ct＝2 －（16－18）＝4
所以Jun基因在处理后表达水平比处理前高4倍
实验数据：

这里的：比率（处理后/处理前）＝2 － Ct（处理后）－Ct（处理前）
似乎应为：比率（处理后/处理前）＝2 － Ct（处理后）+Ct（处理前），否则就不是△Ct了，而是减去Ct（处理后）与Ct（处理前）之和了

花裙子[使用道具]
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发表于 2011-9-2 16:47 资料个人空间短消息加为好友

小中大

那么标准差怎么算啊？我们导师急要，可是我不知道该怎么算？

大猫[使用道具]
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发表于 2011-9-2 16:48 资料个人空间短消息加为好友

小中大

我觉得这个讨论贴严重跑题，重点应该是讨论数据得到后，如何通过分析数据，得到结论性的东西，比如有什么样的差异或意义，这才是我关心的，我项也是多数人关心的，至于detaT，机器软件的算法一般都ok的啦。

小米虫子[使用道具]
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发表于 2011-9-2 16:49 资料个人空间短消息加为好友

小中大

各位老师，我想请教一下，我也是做相对定量，每组数据重复做了三次，但是三次出来的扩增曲线的荧光阈值不相同，在处理是是不是应该先统一阈值，这样的话，CT值也会随着变化，那么，新的CT值之间的相关性会不会变呢，会不会严重影响实验结果。不过，如果不统一阈值而直接用三次的CT值进行计算品均值的话，数据是否成立或者可靠。这样的情况我该怎样处理呢？谢谢

天蓝蓝[使用道具]
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发表于 2011-9-2 16:50 资料个人空间短消息加为好友

小中大

很多人多被这个帖子误导了，仅有一位战友说出了统计方法

何去何从[使用道具]
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发表于 2011-9-2 16:51 资料个人空间短消息加为好友

小中大

请问高人：只做一条曲线行吗？单作内参的曲线，根据内参标准曲线斜率计算目的基因的拷贝数，再与内参相比得出相对表达量？

蓝蜗牛[使用道具]
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