PCR仪 » 讨论区 » 经验共享 » 【求助】利用实时定量PCR和2-△△CT法分析基因相对表达量

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:【求助】利用实时定量PCR和2-△△CT法分析基因相对表达量

fei1226com[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 79957
精华 0
积分 599
帖子 898
信誉分 100
可用分 5286
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-12-18
状态 离线
1
 

【求助】利用实时定量PCR和2-△△CT法分析基因相对表达量


我刚刚接触实时定量pcr,想问一个很肤浅的关于用2-△△CT法分析基因相对表达量的问题。
举例:实验分组:对照组(n=6),实验组(n=6),要比较TGF mRNA表达情况。
是不是对照组的2-△△CT值都是1,而实验组的2-△△CT值都是1的倍数。
比如:对照组2-△△CT值分别是: 1 1 1 1 1 1
实验组2-△△CT值分别是:2.1 2.3 1.8 2.8 1.5 3.0
然后再用两个样本的t检验比较有无统计学差异?
还有一个问题就是:如果上述这样理解是对的,那么对照组2-△△CT值都是1,是不是不能反应对照组个体之间的差异?
谢谢大家的帮助!
顶部
babybabe[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 72893
精华 1
积分 275
帖子 226
信誉分 102
可用分 1936
专家分 10
阅读权限 255
注册 2011-9-15
状态 离线
2
 
你这个是怎么算的,还真看不出来,不过我做的时候是利用2-△△CT公式是用实验组与内参,对照组与内参之间的差值进行计算的
顶部
vivian4123[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 75243
精华 0
积分 417
帖子 494
信誉分 100
可用分 3331
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
3
 


QUOTE:
原帖由 babybabe 于 2015-8-31 11:26 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
你这个是怎么算的,还真看不出来,不过我做的时候是利用2-△△CT公式是用实验组与内参,对照组与内参之间的差值进行计算的

我最近在做类似的实验,2-△△CT到底是怎么算呢,我还是很明白,请指教一下!
顶部
dior[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 72222
精华 1
积分 582
帖子 819
信誉分 102
可用分 4906
专家分 10
阅读权限 255
注册 2011-9-6
状态 离线
4
 

要懂相对定量,就需要先明白为什么要检测内参基因?为什么只检测靶基因不行?明白以后再看看标准曲线法的相对定量怎么算的,然后再由标准曲线法相对定量的问题看看2-△△CT如果解决的,接下来看看扩增效率修正法相对定量怎么回事怎么用。
最后几种相对定量方法各有优缺点。
介绍相对定量的多了去,但是大多数脑子里一团浆糊,所以再怎么说也是捣浆糊。高手有,忙。
顶部
toy[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 77357
精华 0
积分 716
帖子 1052
信誉分 100
可用分 6165
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-16
状态 离线
5
 

对照组不可能全是1的,参照公式


查看积分策略说明
附件
2015-8-31 14:55
84300950.jpg (12.8 KB)
 
顶部
wood533[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 76132
精华 0
积分 863
帖子 1385
信誉分 100
可用分 7745
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-1
状态 离线
6
 

好像现在2-△△CT法用的都不多了,比较粗略,没有标准曲线法好
顶部
wood533[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 76132
精华 0
积分 863
帖子 1385
信誉分 100
可用分 7745
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-1
状态 离线
7
 


QUOTE:
原帖由 toy 于 2015-8-31 14:55 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

对照组不可能全是1的,参照公式

对照组应该都是1 啊!因为计算对照组的时候,减号前面与后面部分相等。即:上述公式计算出来的值为“0”!计算2的零次方,应为1 啊!
顶部
okhaha[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 77505
精华 0
积分 548
帖子 756
信誉分 100
可用分 4651
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-17
状态 离线
8
 

是啊 ,自己搞懂了也不说一下。不过我的理解和lz一样,对照组都是1.我看了一篇文章也是这样做,不过当然反映不出对照组内不同基因的表达差异
顶部