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标题:【求助】抗凝血DNA的提取

xyw5[使用道具]
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姜泊等主编 分子生物学常用实验方法 人民军医出版社1996,p108,原文:(从白细胞中制备DNA)取全血5ml,用3.8%柠檬酸钠或2%的EDTA(以NaOH调PH至7.4),1/10体积抗凝,1500r/min离心5min。
我就是这样用的EDTA,我加了0.2mlEDTA,因为有本书是协和医科大学出的,主编 惠汝太,书不厚,名字记不清了,也是这样。
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kswl870[使用道具]
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1. 通常可用EDTA-、柠檬酸-、ACD等抗凝全血,并提取基因组DNA,最好不要用肝素抗凝。我们常用柠檬酸或ACD抗凝。直接用采血室里的采血袋就好,袋子上通常都标明了抗凝剂的使用比例。
2. 抗凝全血在2-8度可保存达两个月,但随保存时间的增加,DNA的得率和完整性会受影响。
3. 冷冻全血当然是在-80C最好。-80C x 4年,-20C x 1年的冷冻全血我们都提过,得率在未冻全血的60~80%。有些经多次冻融的就有些惨了,只有30%多。 Sad
4. 对冷冻全血需重复细胞裂解步骤,以保证将红细胞完全裂解,但会减少纯化所得DNA的量。
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采用改良Miller法抽提人白细胞DNA
1.试剂配制
•  1M Tris-HCl (pH8.0) 500ml
60.55g Tris 碱溶于400ml蒸馏水中,用浓HCl 调 pH8.0 (用浓HCl加量约21ml), 定容到500ml, 高压灭菌。
•  0.5 M EDTA (pH8.0) 500ml
在400ml蒸馏水中加入93.05gEDTA-Na盐,在磁力搅拌器上剧烈搅拌,用NaOH调节pH至8.0 (约需10g NaOH颗粒),然后定容到 500ml,高压灭菌。
•  10% Triton-X 100 500ml
•  10% SDS 200ml
20gSDS溶于160ml蒸馏水中,加热至68℃助容,加水定容至200ml,备用。
•  蛋白酶K 10mg/ml 溶于水,分装于小离心管中,-20℃保存。
2、 DNA提取步骤
•  去柠檬酸钠或EDTANa2抗凝全血5ml(尽量不用肝素抗凝),置于50ml有盖离心管中。
•  加入5-8倍体积(约40ml,将离心管加满即可)冷蒸馏水,反复颠倒混匀,冰中放置5min,4×3750rpm,离心20min。
•  缓慢倾倒上清,再沉淀中加入预冷的0.1% Triton-X 100 (体积同上),轻柔混匀沉淀,如有离心,弃上清。
•  沉淀中加入2ml裂解液,彻底打碎沉淀,然后加入10%SDS 100 μl(至终浓度为0.5%),混匀。
•  加入10mh/ml蛋白酶K 40 μl(至终浓度为200 μg/ml),混匀,55℃, 3小时;或37℃,过夜消化(以过夜为佳)。
•  加入6.0M NaCl 0.7ml,剧烈振荡20秒。
•  3750 rpm 离心40min,将上清移至另一有盖离心管中。
•  加入2倍体积(约5.2 ml)无水乙醇或95%乙醇,反复颠倒混匀至出现絮状DNA沉淀,调处DNA之一Eppendorf 管中。
•  75%乙醇洗涤2遍。将DNA保存在75%乙醇中,放置于冰箱中(-20℃)备用。
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qhyu[使用道具]
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我觉得提取冻存的抗凝血DNA时,裂解红细胞的时间应该缩短,这样提取出的DNA的量会多一点。我们一般是用ACD抗凝。
ACD配方:单结晶水柠檬酸 (分子量210.1) 8.0g
柠檬酸三钠(分子量 294.1) 22.0g
单结晶水D-葡萄糖 (分子量 198.2)24.5g
顺次溶于蒸馏水中,定容至1000ml,过滤除菌。分装后-20°C保存。
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yizhi[使用道具]
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请问EDTA加多了对DNA提取影响有多大?5ml的全血(新鲜)加了1ml的EDTA,有机法提出的DNA经过定量只有300ng/ul
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is2011[使用道具]
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⑺ 上清液加等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:10),
中不是10,而是1吧!!
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greenbee[使用道具]
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我是用EDTA抗凝的冻存的全血,请问用您的方法可以提取出DNA吗?我操作是需要注意哪些问题呢?期待你的回答。**
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ending[使用道具]
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Protocal
1. 分离外周血白细胞
(1)取患者肘静脉血5ml,EDTA抗凝,2500rpm离心10 min。
(2)小心吸取上层血浆,分装到3个0.5ml离心管中。
(3)在血细胞中加入3倍体积的溶血液,摇匀,冰浴15 min。
(4)2500rpm离心10 min,弃上清。
(5)加入10ml溶血液,摇匀,冰浴15 min。
Devil3000rpm离心10 min,弃上清。
(7)倒置离心管,去掉残液。
Musical Note得白细胞,-80ºC冻存。
2. 从白细胞中提取基因组DNA
(1)取白细胞,加4.5ml SE,使劲吹打,混匀。
(2)沿管壁加入0.5ml的10%SDS。
(3)加蛋白酶E 50μl/管。
(4)首尾轻摇10 min,混匀。
(5)37ºC水浴过夜。
Devil第二天取出,沿管壁加3 ml饱和NaCL,迅速手摇15秒,使蛋白变性析出。
(7)4000rpm离心10 min。
Musical Note取出上清,放于另一管中,加入等体积的三氯甲烷,混匀15 min。
(9)2500rpm离心10 min。
(10)取出上清,加入等体积的三氯甲烷,混匀10 min。
(11)2500rpm离心10 min。
(12)取上清,转入50ml管中,加3倍体积无水乙醇。
(13)首尾轻摇,见DNA絮状沉淀析出。
(14)将DNA挑至管壁,75%乙醇洗涤2遍。
(15)将DNA挑至0.5ml管中,冻干。
(16)加TE 300μl,使DNA溶解,4ºC保存。
请问douxiangfeng :您的操作步骤中使用的是蛋白酶E,在其它文献中提到的是蛋白酶K,而我手里也只有蛋白酶K ,请问蛋白酶E和蛋白酶K 有何区别?另外用您的方法提取库存抗凝血可以吗?
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veiwu[使用道具]
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用ACD 怎么样 啊?我的怎么扩不出来了???
肝素是可以使用的啊!
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