小中大U6和RNU6B不是同一种control,简单来说U6的表达量相对RNU6B来说是更高的,也就是同样的条件下Ct值会更小。
to 跟帖的战友:
根据我个人的经验谈一下血液内参的问题:
1 首先应该确认一下是不是内参和目的的microrna都做了,因为如果只做了U6,发现Ct值很大的话,就下结论说这个内参不好是不太科学的,也许是你提取的RNA量或者反转录时加入的rna量就少。目前U6在血液中做内参的还是不少的。一般Ct能够在20-25之间。提示:由于U6的序列长度大于200,所以在提取时看一下试剂盒说明,例如,如果说试剂盒说明书中提到采用这种方法提取只能提取到nt小于200的片段,那实验就白做了。
2 mir-21,mir-16,mir-126也有人用来做血液mirna选为内参的
3 本来内参就是根据自己的实验才能确定的,没有千篇一律的内参。只能说U6大家使用做内参的概率比较大,但并不一定真的适合你的实验。