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标题:【求助】qPCR如何确保复孔一致性

bring[使用道具]
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【求助】qPCR如何确保复孔一致性

目前正做qpcr,引物特异性没有问题,目前就是副孔,重复ct值相差太大,相求助战友们
就我而言,我现在做的是20ul体系
现配总的混合液,之后每个样品都配混合液,再涡旋5秒钟,枪头吹打5下,之后上样
但是结果还是不能确保,ct值相差非常大
所以,我想知道大家都是怎么混合的?有什么经验方法可以指教下
ps:加样时候是不是必须加到管底?
总结就是:如何混合?如何加样?
不甚感激!。。。。
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cocacola[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 bring 于 2015-10-7 15:40 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
目前正做qpcr,引物特异性没有问题,目前就是副孔,重复ct值相差太大,相求助战友们
就我而言,我现在做的是20ul体系
现配总的混合液,之后每个样品都配混合液,再涡旋5秒钟,枪头吹打5下,之后上样
但是结果还是不能确保,ct值相差非常 ...

我们加样没有加到管底,最后用离心机离的。
同一种引物的按量算好和mix一起配的混合液,然后每孔加,最后单独加的cDNA模板。
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bring[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 cocacola 于 2015-10-7 15:55 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

我们加样没有加到管底,最后用离心机离的。
同一种引物的按量算好和mix一起配的混合液,然后每孔加,最后单独加的cDNA模板。

我很想知道你们没加到管底,离心多久,多大转数?我个人感觉还是会有少数几个孔会有气泡,并且还是在离心后
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caihong[使用道具]
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我建议,配总管的时候,是加水,mix和cDNA模板。混匀,每孔加好,最后再加引物的,因为20ul体系中经常只需要1ul的模板,如果是最后每个孔每个孔的加,枪头外带一点点,误差就会大。至于要不要加到管底是无所谓的,一离心就会到管底的。还有气泡的问题,我们知道,PCR开始的时候,温度是升高到95度的,这样的高温,气泡都会破的。
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woshituzhu[使用道具]
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原帖由 caihong 于 2015-10-7 15:57 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

我建议,配总管的时候,是加水,mix和cDNA模板。混匀,每孔加好,最后再加引物的,因为20ul体系中经常只需要1ul的模板,如果是最后每个孔每个孔的加,枪头外带一点点,误差就会大。至于要不要加到管底是无所谓的,一离心就会到管底的。 ...

就离一会,转速不知道是多少呢?我都没有离固定时间的。呵呵
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bring[使用道具]
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原帖由 caihong 于 2015-10-7 15:57 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

我建议,配总管的时候,是加水,mix和cDNA模板。混匀,每孔加好,最后再加引物的,因为20ul体系中经常只需要1ul的模板,如果是最后每个孔每个孔的加,枪头外带一点点,误差就会大。至于要不要加到管底是无所谓的,一离心就会到管底的。 ...

可是我加入的DNA模版不同,如何配总管啊?相反我的引物是同样的,可是照你的意思,我加入1-2ul 模版应该就会误差很大,如何解决这个问题啊?
PS:顺便问下阴性对照有结果,怎么办?谢谢啦
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jude[使用道具]
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我一般先加模板,然后加引物,最后加mix,每个孔pipette10来次,然后简单转一下,去掉气泡(这步也不是很必要),平行的空,大部分小数点后一位到两位的误差是正常的
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ns5fan[使用道具]
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我是一个样品配一个总管。阴性对照有结果是不是你有污染或者操作不当?我之前有一次做的时候发现阴性对照的CT值也在30之前,后来发现是仪器的问题,换了台仪器就好了。
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seagate[使用道具]
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我建议,配总管的时候,是加水,mix和cDNA模板。混匀,每孔加好,最后再加引物的,因为20ul体系中经常只需要1ul的模板,如果是最后每个孔每个孔的加,枪头外带一点点,误差就会大。至于要不要加到管底是无所谓的,一离心就会到管底的。还有气泡的问题,我们知道,PCR开始的时候,温度是升高到95度的,这样的高温,气泡都会破的。

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引物加的更少吧,也就0.4ul,比模板要少,按您的说法“最后每个孔每个孔的加,枪头外带一点点,误差就会大”,就算最后加引物是不是也同样存在误差大的问题呢?如果担心枪头外带一点点误差大的话,可以换枪头吧,不过有点浪费。
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vera+[使用道具]
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对每一台q-pcr仪做不同的实验,需要试条件,重复多次,达到稳定后才正式实验。这样就好了。
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