小中大做了将近两个月pcr,时间不长,但酸甜苦辣,个中滋味,只有自己才能体会,在pcr版潜水了两个多月,学到了很多的东西,下面也简单说说我的一些心得,上面战友提到过的一些我就不多说了,希望能对其他战友有所帮助,有所启发,说得不对的时候,也希望战友拍砖。
1 先说污染问题,对于一般的pcr,个人认为没有那么邪乎,去超净台麻烦,我直接在我的实验台操作,tip头高压灭菌,ep管进口的,直接取用,别说口罩,帽子,手套后来我都未戴,也没有发生污染的事,可能也和周围环境有关
2 操作细节:冰上加酶(一般酶的说明书都有说明原因),且放入pcr仪之前,pcr仪需达到94度(即预变性这步),尽可能提高反应特异性。
3 一般pcr,设55、60、65度退火,一般第一次都能p出,如无则设67度和50度,再无换引物
4 对于重叠pcr,园子里战友一般讨论模板量太高P不出来,我却碰上了量太少而P不出来的情况,当时怎一个郁闷了得,也对具体情况具体分析有了更深的认识;再有就是不同公司的酶确实有差异,我先用takara的rTaq预试验,然后pyrobest突变,在一段基因上突变了两个,但是到第三个点的时候,死活重叠不出来,整整耽搁了两周,当时都快崩溃了,后来我抱着死马也当活马医的想法试了fermentas的pfu,居然扩出了很清晰的目的条带,今天测序结果发回,三个点全部突变成功,所以实在P不出来时可以试着换下试剂
5 关于2次pcr,我和实验室师姐都碰上了胶回收会再P却p不出来的现象(用takara的回收试剂盒),园子里战友分析说是乙醇残留导致的,后来直接取产物2次p,结果还可
6 原来只是听说dNTP反复冻融会变性,真让我一同学碰上了,大半管的dNTP居然不起作用了。。
pcr过程中会碰到很多问题,碰到问题就要troubleshooting,这才是不断学习的过程,都说pcr很难,但只要多一点细心,多一点恒心,多一点耐心,肯定会得到你所需要的结果,借用在园子里看到的一句话与大家共勉:往往当你崩溃的时候,也就是pcr结果出来的时候!我是真正经历过了,你呢?