小中大1.关于操作不规范是这样的,比如我们几个同学一起做定量,用的试剂,模板,引物,仪器啊什么都是一样的,但有的同学就能做出引物二聚体,有的就没有,所以说引物应该是没问题的,那不同之处就在于操作。老师说不能操作太暴力,轻柔一点比较好。
2.你的目的基因的丰度太低了,不能加大一些模板量?CT值35,36是不是太靠后了?这样能接受吗?我们这边都得35以前。
3.你的NTC中就是什么扩增?也没有引物二聚体啊?一般如果是引物二聚体,在NTC的融解曲线中看得比较明显,TM值大约在70-78左右。污不污染还是应该看NTC的扩增,量小的话,跑胶是看不出来的。
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1.第一点我赞同。有时候不同的人操作,好像结果确实会不太一样。不过,对于这一点我也无法去进行很明显的改进。
2.我的样本量非常少,然后基因的丰度又很低。模板量实在不能再往上加了:我的样本是用Mini Kit抽,加水量是用的最小洗脱量,反转出来的CDNA都不稀释直接上量1ul进行QPCR。有的CT值超过32都认为不能接受。我是想着如果NTC在40个都没有扩增的话,那我就接受35,36.
3.NTC是水扩增,溶解曲线里没有任何产物扩增峰或二聚体峰,电泳没有可见条带。