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标题:[未解决]是不是应该用乳酸菌的通用引物呢?

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大球球[使用道具]
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是不是应该用乳酸菌的通用引物呢?

我做的是奶酪中筛非发酵剂乳酸菌。但是现在筛出来的菌测序之后用blast比对出来后几乎全是表皮葡萄球菌,要不就是不可培养细菌。然后我的引物是v3-v4区,
Nobar-341F(CCTACGGGNGGCWGCAG)。 Nobar-805R(GACTACHVGGGTATCTAATCC)。大家觉得我的引物有问题嘛?是不是应该用乳酸菌的通用引物呢?
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美丽婷婷[使用道具]
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个人感觉引物问题不大,乳酸菌用常见的通用引物就可以鉴定。极可能是筛选条件有问题,不利于乳酸菌生长。nslab一般是lactococcus属和lactobacillus属的,lactococcus属的菌株25℃培养,lactobacillus可以用专门的筛选培养基试试,例如sl或酸化mrs。最好厌氧。
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那就是问题出现在筛菌了,你要纯化镜检生理生化鉴定差不多了是乳酸菌再去测序啊!乳酸菌一般用细菌通用引物就可以
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千里之外[使用道具]
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对,试试乳酸菌通用引物
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