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标题:【求助】PCR反应体系

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我今天按照您的吩咐分管做了,并且把退火温度调到62度,结果特异性条带出来了.今天没加上游对照引物,等我明天再分管加一个上游对照引物,等结果出来,我给您看看电泳结果.来共同享受一下咱们的努力结果!谢谢!!!
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你好!我已给你把电泳结果发到你的邮箱里,请你抽空过目. 在电泳图中第一条条带为MARKER,其他每三条为一个标本,依次类推,共做了三个标本.其中在标本的三条条带中第一条检测4G基因,第二条检测5G基因,第三条是上游对照.今天用的退火温度仍为62度.希望您能给予宝贵意见!争取做出最满意的实验结果!!!谢谢!!!
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请你有空看看我的今天实验的反应体系: 首先加入去离子水16.5UL,10成的缓冲液2.5UL,25UM/L镁离子1.5UL,下游引物25UM/L0.4UL,4G引物25UM/L0.4UL,10MM/LDNTP0.4UL,TAQE0.3UL.最后加入模板DNA3UL.总体系达25UL.其他5G.上游对照引物的加量与4G反应管一样. 请你帮我分析一下,是什么原因导致出现那么多的杂带?并且我该去如何改进呢?谢谢!
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你好!我已给你把电泳结果发到你的邮箱里,请你抽空过目. 在电泳图中第一条条带为MARKER,其他每三条为一个标本,依次类推,共做了三个标本.其中在标本的三条条带中第一条检测4G基因,第二条检测5G基因,第三条是上游对照.今天用的退火温度仍为62度.希望您能给予宝贵意见!争取做出最满意的实验结果!!!谢谢!!!

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刚刚看了你的电泳图(如下),内参照和4G的温度已经比较稳定了,但是5G的条带不稳定,第一个和第二个样本杂带比较多,但是第三个样本的5G 条带很好。
建议:
用62度重新跑一次第一和第二样本的5G ,如果还是没有稳定的目的条带,那就单独跑一个5G 的退火温度梯度(从60~68),比较一下那个温度条带最清楚!
至于下面的引物二聚体,暂时不要管他,等5G的退火温度稳定了之后在调整!
另:以后可以直接将电泳图贴到帖子上,也方便其它战友帮你出主意!!!
如何贴图请见:
cuturl('http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=111&id=1399406&sty=1&tpg=1&age=0')
你的电泳图:


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2015-11-7 11:48
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谢谢!你说是不是由于我的反应体系中加的TAG酶过量引起的杂带呢?望赐教!!!
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因为我的标本中4G和5G基因型出现的频率是随机的.意思是在第一个和第二个5G反应管中可以不出来条带.能不能把它单纯地看为过量引起的杂带呢?你说我能不能把酶量减少来看看呢?望指点!谢谢!!!
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一般情况下杂带的产生是由引物的退火温度引起的,与Taq酶的量没有关系。
所以建议还是先考虑退火温度!!
第一和第二个样本的5G 产物中,在240bp 的位置都有特异性条带,而且第二个样本的特异性条带还比较明显。其它条带是很明显的退火温度差异引起的杂带。
故优先考虑做退火梯度!
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好的 听兄弟一点,我也好象看到了240B P处的条带,正如老兄所说,可能就是由于退火温度引物的杂带,我明天遵照老兄指点,再专门做一下第一 .二个标本的5G基因型.太感谢了!又学了一招!
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一下是小弟我今天的实验结果.前面的条带是MARKER,后面依次为昨日三个标本的5G引物出来的条带;今天用的退火温度是64度.望赐教!谢谢!
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电泳结果如下


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