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标题:请问:有关RNA提取和RT-PCR

魔法师A[使用道具]
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楼上各位各抒己见,在下深表同意,有点点个人体会不妨跟大家共享,望批评指正。固然液氮保护下研磨是RNA不降解的最有力的保证,可是也有不易操作的缺点,就我做来的经验,一旦经液氮冷冻,组织就会变得坚硬无比,研磨起来颇有难度,而且尽管小心再小心,弄不好还是会碎屑飞溅,损失一些。或者是我操作的不对,因为一直以来本人都是摸着石头过河,没有机会观摩他人的操作,在这里如果能够得到哪位战友的指点,将不胜感激。言归正传,我认为是否有液氮保护可视组织的质地而定。比如,我第一次提取组织RNA遇到的就是硬骨头,没有办法,只好用液氮了,效果不错;后来轮到软的组织,也如法炮制,发现一旦入了液氮,竟然变得和骨头一样的坚硬,这样岂不是辜负了人家起初的天生软质,试着改成加入TRIzol后匀浆的办法,结果出来也很好,有图像为证(左为液氮法,右为改良法),而且提到的量也较多,主要是省事了许多。我们这里有人提取肾的RNA,不需液氮效果也不错。
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好像对于肾脏、肝脏等软组织是可以不用液氮。
但我做的是皮肤呀?!只有用液氮咯?
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为什么非要用液氮研磨呢?需要说明的是液氮主要起快速冷冻的作用,RNA在低温时不降解!!!不论任何组织或细胞的提取液都不是液氮,而是Trizol。而且液氮确实不好研磨,蒸发快,所以不能保证RNA的不降解。所以个人认为最好的方法是组织(包括皮肤哦)直接在Trizol里研磨。接着继续进行抽提!
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雷子![使用道具]
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强烈推荐Trizol,
昨天刚刚提取的rat的十种不同器官的RNA,用的就是trizol,
A260/A280都在2.2以上。

好像是降解了!
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缘yuan[使用道具]
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弱弱地问:trizol 是什么试剂?在RNA提取中起啥子作用啊?  
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我也想请问trizol 是什么试剂?hansontcm战友所说的“Takara的Catrimox-14”又是什么试剂?它们都是提取RNA的试剂吗?那我用的Promega公司的RNA提取试剂盒,说明书上怎么没有提及“trizol 试剂”呢?哪位大哥可以给我解释一下,谢谢!

另外,我查找文献,发现好像没有谁用Balb/c的皮肤做过RT-PCR,不知道这是不是真的。请问有谁发现过这方面的文献吗?谢谢!
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“为什么非要用液氮研磨呢?需要说明的是液氮主要起快速冷冻的作用,RNA在低温时不降解!!!不论任何组织或细胞的提取液都不是液氮,而是Trizol。而且液氮确实不好研磨,蒸发快,所以不能保证RNA的不降解。所以个人认为最好的方法是组织(包括皮肤哦)直接在Trizol里研磨。接着继续进行抽提!”

好像说得有道理吔!
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我也想请问trizol 是什么试剂?hansontcm战友所说的“Takara的Catrimox-14”又是什么试剂?它们都是提取RNA的试剂吗?

Takara的Catrimox-14是RNA Isolation Kit 中的一个组分,他是一种裂解液、还有变性的作用,有助于裂解细胞,同时Catrimox-14还可以结合RNA形成一种稳定的复合物,接下来除去不需要的物质,剩下Catrimox-14-RNA再从中提取RNA。trizol 也是一种裂解液,他是intrivogen公司的产品,非Promega产品。
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我用Takara的Catrimox-14提贴壁细胞也没提出来,不过在原因未分析清楚之前我不想随便臧否Takara的产品,毕竟以前用过不少Takara的产品都还是不错的。

我是这样操作的:先用胰酶将细胞消化下来,用PBS洗涤后,去掉PBS,加入Catrimox-14,可是在加LiCl之前就没看到沉淀,因为在加入LiCl之前DNA及各种杂蛋白都还在,应该能看到沉淀的。逆转录PCR没P出来,但是对照RNA P出来了,说明逆转录和PCR都是没问题的,唯一的问题就是RNA没提出来。

提RNA的操作和所用的枪头管子都没有问题的,因为我又不是第一次提了,我不知道是不是不应该用胰酶消化,因为TRIzol的说明书上说提贴壁细胞时先倒掉培养液,然后直接将TRIzol加到瓶子里裂解细胞。

还请有经验的兄弟看看我的分析有没有道理啊!
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INK[使用道具]
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"Takara的Catrimox-14是RNA Isolation Kit 中的一个组分,他是一种裂解液、还有变性的作用,有助于裂解细胞,同时Catrimox-14还可以结合RNA形成一种稳定的复合物,接下来除去不需要的物质,剩下Catrimox-14-RNA再从中提取RNA。trizol 也是一种裂解液,他是intrivogen公司的产品,非Promega产品。 "

那Promega用的又是什么呢?I don't know.
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