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标题:[分享]miRNA用荧光定量PCR检测的流程以及汇总

还是孩子[使用道具]
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提取的卵巢组织总RNA浓度还可以,就是OD260/OD280偏低,不知道对后续的荧光定量有没有影响?
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还是孩子[使用道具]
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提取的卵巢组织总RNA浓度还可以,就是OD260/OD280偏低,不知道对后续的荧光定量有没有影响?
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菠萝菠萝蜜[使用道具]
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国内就会赶风,没想到现在有这么多人做小RNA  

不错 我也正在测血浆中的microRNA 受益匪浅
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豆荚[使用道具]
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我最近做miRNA的QRT-PCR,反转录引物和PCR引物都购自广州某公司,将目的miRNA和U6的反转录引物加到同一管中进行逆转录,后首先跑了一次普通PCR,发现在100bp附近都有明显条带。在正式QRT-PCR之前尝试将模板倍比稀释做了下标准曲线,发现U6的扩增效率为0.97,而目的基因的扩增效率为0,即无论我如何稀释样本,detaCT值不变,溶解曲线也都是单峰。我考虑是目的基因的反转录或PCR引物有问题,请问各位同道,是否碰到此类情况,该如何解决,是否有可靠的公司能够代替设计合成此类引物。
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我的实验又失败了,555555.我想问一下,你们的试剂一般哪里买的,最近一家试剂代理说什么TIANgen(天跟)microRNA试剂盒,tiangen好像是国内的厂家,试剂的可信度应该比较低吧?买试剂应该到哪里买比较好点?有microRNA试剂盒吗?哪家的?哥哥姐姐们,给我的建议啊。你们试剂都哪里买的?跟我分享一下你们的经验?谢谢了。55555,做实验好苦啊。。。。。
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tears[使用道具]
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楼主,说说实验数据分析这块的内容吧,对这部分很迷茫,谢谢,嘿嘿。
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楼主,您好,我想问一下一般做定量PCR的时候,选择什么来做reference,我用的是ABI的仪器,我一般用版内的一个标本来做内参,但分析结果的时候,很不稳定,所以想请教一下;还有,如果多次少量分批次做定量PCR,会不会因为每次选择的reference不一样,而影响把不同批次的结果合并分析时的最终结果,谢谢!
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大哥,大姐们,我又回来了,我的实验又失败了,555555.我想问一下,你们的试剂一般哪里买的,最近一家试剂代理说什么TIANgen(天跟)microRNA试剂盒,tiangen好像是国内的厂家,试剂的可信度应该比较低吧?买试剂应该到哪里买比较好点?有microRNA试剂盒吗?哪家的?哥哥姐姐们,给我的建议啊。你们试剂都哪里买的?跟我分享一下你们的经验?谢谢了。55555,做实验好苦啊。。。。。

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我用的是ABI的试剂盒,已发表的文章中用这个产品的人比较多,就是价格肯能高一点。
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强烈要求楼主说说数据分析的问题,呵呵
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不知道这种方法与上两种方法比较怎么样?兄弟可以把这个产品的实验方法发下或者把该公司的说明书影印一份,供大家参考。或者您以上方法都用过,希望给个参考信息。

我的本意是提供一个集中的关于MiRNA的平台,大家可以在这里互通有无。所以希望广大有经验的战友多多提供意见以及帮助,而不是光有我在这里班门弄斧。

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这种方法是一个叫做MiraMas的kit中所使用的,制造商是美国的Bioo Scientific公司。我给它起的名字叫通用接头连接法:
在RT步骤,该kit通过试剂盒内含的特殊ligase连接5’端腺苷化且3’端封闭的寡核苷酸接头(Adenylated 3’ Ligation Adapter)于所有miRNA的3’末端,然后通过与该接头序列互补的3’端引物经M-MLV反转录酶将所有miRNA同步反转录成cDNA。

主要优点:
1.比加A尾法更高的反转录效率:
"The advantage of adding the 3' adapter sequence using RNA ligase as used in MiraMas kit, provides higher specificity for priming the reverse transcription step and also the binding site for the Reverse PCR primer only at the 3' ends of the RNAs, compared to using polyA polymerase to add homopolymeric A's followed by hybridization of the oligo dT/adapter to provide the binding sites for RT and Rev PCR primer. The problem with the polyA approach is that the oligo dT can hybridize to internal homopolymeric A regions in mRNAs, instead of only to 3' end."

2.更多的单样品miRNA检测数量:
"Each MiraMas reaction can be used to make cDNA library to allow for analysis of 10's - 100's of microRNA targets (depending on mass amount of input RNA), compared to Qiagen kit each reaction only makes enough cDNA for around 5 target microRNAs. And Qiagen kit does not allow flexibility to use high or low input amounts of RNA. Using the low input amounts, researcher can process lots of samples from one kit."
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