PCR仪 » 讨论区 » 经验共享 » [分享]miRNA用荧光定量PCR检测的流程以及汇总

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:[分享]miRNA用荧光定量PCR检测的流程以及汇总

眼药水~[使用道具]
二级
Rank: 2


UID 73410
精华 0
积分 134
帖子 48
信誉分 100
可用分 931
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-9-22
状态 离线
71
 
PCR结果3


查看积分策略说明
附件
2011-10-6 12:53
11058674_snap.jpg (41.49 KB)
 
顶部
眼药水~[使用道具]
二级
Rank: 2


UID 73410
精华 0
积分 134
帖子 48
信誉分 100
可用分 931
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-9-22
状态 离线
72
 
miRNA PCR荧光值基本上在哪个范围?是不是在0-1之间?????请楼主给我的指导
顶部
我佛慈悲[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 74054
精华 0
积分 188
帖子 135
信誉分 100
可用分 1401
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-4
状态 离线
73
 
楼上的,你说的是不是阈值和基线?
顶部
avi317[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 74131
精华 0
积分 566
帖子 811
信誉分 100
可用分 4896
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-6
状态 离线
74
 
正向引物:序列5,-ACACTCCAGCTGGGGTCCAGTTTTCCCAGGA -3,
URP:统一反向引物,也是一段固定的序列,TGGTGTCGTGGAGTCG
U6引物F-CTCGCTTCGGCAGCACA ,R-AACGCTTCACGAATTTGCGT

==============================================================================================================

你好,由于您的图片看不到,只能就您的引物来分析下:就您的正向引物来讲,这个引物的TM值高达76度,而反向引物TM值只有51度。从这里分析:这对引物由于TM相差实在太多,(Primer Express3的参数)我以前做的是在正向引物的5‘端加几个类似保护碱基就够了,没有像您那样加的那么多,而且在引物设计时,最好能引物设计和本身序列两方面都考虑下,找个折中的引物序列。而且检测基因的引物跟您的U6引物的TM值最好相近(毕竟您要他们在一个PCR仪里面同时工作)。
PCR产物没有的话应该没扩增。如果您的实验有CT值的话,请问做没做NTC?NTC有没有CT值?
希望对你有用。
顶部
blueeye[使用道具]
二级
Rank: 2


UID 72961
精华 0
积分 134
帖子 48
信誉分 100
可用分 936
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-9-16
状态 离线
75
 
你说的是不是阈值和基线?

===================

不是,是荧光积累高度
顶部
胖小妮子[使用道具]
二级
Rank: 2


UID 70442
精华 0
积分 149
帖子 77
信誉分 100
可用分 1061
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-8-10
状态 离线
76
 
你好,由于您的图片看不到,只能就您的引物来分析下:就您的正向引物来讲,这个引物的TM值高达76度,而反向引物TM值只有51度。从这里分析:这对引物由于TM相差实在太多,(Primer Express3的参数)我以前做的是在正向引物的5‘端加几个类似保护碱基就够了,没有像您那样加的那么多,而且在引物设计时,最好能引物设计和本身序列两方面都考虑下,找个折中的引物序列。而且检测基因的引物跟您的U6引物的TM值最好相近(毕竟您要他们在一个PCR仪里面同时工作)。
PCR产物没有的话应该没扩增。如果您的实验有CT值的话,请问做没做NTC?NTC有没有CT值?
希望对你有用。

==========================================================

我问一下 你那个PCR的荧光积累高度是多少?我只有0.5-1 是不是太低了
顶部
avi317[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 74131
精华 0
积分 566
帖子 811
信誉分 100
可用分 4896
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-6
状态 离线
77
 
荧光积累高度??不是很懂。这样说吧,在扩增曲线的纵坐标(应该是这个吧)有3种情况,每个情况的纵坐标的数值是不一样的。如果纵坐标是代表“Fluorcscence”所谓的荧光增长值的话,几k到10k又会有的,如果纵坐标是“DATE Rn”的话,log值0.1到1啊什么的小数值也很正常,就是线性数值0.1到100也可能的。

============================================================================================

所以不必在意那个数值,如果你非要看荧光增长值(也许就是你说的荧光积累高度吧),可以调到“component”界面来看
顶部
鲁西西[使用道具]
二级
Rank: 2


UID 72159
精华 0
积分 132
帖子 44
信誉分 100
可用分 911
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-9-5
状态 离线
78
 
用软件Primer 5做引物设计时,那个序列是cDNA序列或直接将miRNA的序列中的U改成T
顶部
鲁西西[使用道具]
二级
Rank: 2


UID 72159
精华 0
积分 132
帖子 44
信誉分 100
可用分 911
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-9-5
状态 离线
79
 
用软件Primer 5做引物设计时,那个序列是cDNA序列或直接将miRNA的序列中的U改成T?如:GUCCAGUUUUCCCAGGAAUCCCU把其中的U改成T就输入DNA序列中行不行啊?  
顶部
avi317[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 74131
精华 0
积分 566
帖子 811
信誉分 100
可用分 4896
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-6
状态 离线
80
 
不知道PP5有没有自动换算U————>的功能,忘记了,你可以都试试看啊。

不知道其他战友用过没??
顶部