小中大楼主您好,我也是刚开始做RT-PCR,有几个问题想向您请教一下
1。我想分离血液中的单个核细胞,再从单个核细胞中提取总的RNA检测microRNA,请问是不是可以用Trizol提取总的RNA,还是一定要买特异性的microRNA专提试剂盒
2.在我查阅的外文文献中基本上绝大多数都是用ABI公司的Taqman探针法或者茎环法做的,基本上没有使用染料法检测microRNA,是不是因为探针法特异性高,能特异性的检测成熟的microRNA,避免了前体的干扰,因此SCI的文章不接受染料法做的microRNA的结果
,必须使用探针法或者茎环法这种特异性高的检测方法才可
3.使用探针法检测,是不是常规预先需要使用染料法摸索反应条件?
4。探针法所需要的引物和特异性探针是不是均可以向ABI公司购买?检测一条成熟的microRNA所需试剂(以ABI公司产品为例),大概需要多少费用
非常感谢楼主能百忙之中能解答,谢谢了
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1、既然颈环状的RT引物,就不需要刻意提取MiRNA了(单细胞本来RNA就不多),由于单纯Trizol分层提取的RNA中MiRNA的的量比较少,既然楼上的经费比较充足,还是在Trizol处理后过下柱吧(可以收集miRNA的KIT的柱子)。
2、颈环RT引物和探针的PCR方法特异性确实比染料法高(您也知道MiRNA的PCR片段太短,用染料法会有二聚体干扰),当然,在前期为了节省成本,先用染料法优化好RT引物、PCR引物后再设计探针会比较好一点(周期可能较长)。至于发外文用什么或者有什么规定我也不清楚,我个人以为你说得有道理。
3、当然不一定必须使用染料法摸索。如果RT引物和探针买的话,直接用就可以了。价钱每个地方可能不一样吧,你最好问下AB的代理或者销售,也许他们有啥优惠活动呢(YY下)。
4、我是买了AB 的内参的RT引物和PCR引物探针的一套,然后参考文献说明自己设计RT引物、PCR引物和探针,用AB的做参照。毕竟我的经费不多。
希望对您有所帮助。