小中大我现在试着从骨骼肌组织提RNA,跑电泳点样孔附近无明显亮带可见,但OD值始终在1.3-1.5,说明还是有蛋白或酚等污染对吗?
虽然琼脂糖电泳可见清晰三条带,无smear降解片状影出现,但5s最亮,28s最暗,逆转录后PCR也没有产物。我想可能就是RNA中混有了蛋白或酚,影响了逆转录过程,对吗?
最后用乙醇洗涤的步骤,是不是和OD值偏低也有影响?因为用异丙醇沉淀后,rna已成胶状沉淀,加乙醇后用不用轻弹管壁至RNA完全溶解后再去离心?
请多指教,谢谢!
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一般来说,提取的RNA OD值偏低可能混有蛋白污染,RAN实际上在酒精洗涤时是不溶解的,应该看到的是白色沉淀,洗时我觉得应该把轻弹管壁弹能够充分洗涤.
逆转录后PCR没有产物的原因很多,不知道你有没有同时跑内参,如果能跑出内参说明你的反应体系是好的;有的RNA有轻度降解时照样能跑出内参, 但对于目的基因特别是长片段及表达不高的就困难了,能否跑出目的基因还要看退火温度,退火温度不合适,也跑不出,当然引物也有关系.