PCR仪 » 讨论区 » 经验共享 » 【求助】为什么我的扩增效率这么高?

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:【求助】为什么我的扩增效率这么高?

tie8[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 75844
精华 0
积分 442
帖子 543
信誉分 100
可用分 3571
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-28
状态 离线
1
 

【求助】为什么我的扩增效率这么高?

这是我做的一个实时PCR的CDNA的标准曲线,5倍稀释度,可是反应效率却很高,达到137%,不知为什么,也没有引物二聚体,产物跑胶也只见单一条带。用的是sybrgreen mix,toyobo公司的产品。


查看积分策略说明
附件
2016-2-6 10:00
23508222.jpg (23.65 KB)
 
顶部
tie8[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 75844
精华 0
积分 442
帖子 543
信誉分 100
可用分 3571
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-28
状态 离线
2
 

这是融解曲线


查看积分策略说明
附件
2016-2-6 10:00
92744786.jpg (17.27 KB)
 
顶部
tie8[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 75844
精华 0
积分 442
帖子 543
信誉分 100
可用分 3571
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-28
状态 离线
3
 

这张是ct 值


查看积分策略说明
附件
2016-2-6 10:02
19674697.jpg (22.78 KB)
 
顶部
tie8[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 75844
精华 0
积分 442
帖子 543
信誉分 100
可用分 3571
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-28
状态 离线
4
 
这张是标准曲线


查看积分策略说明
附件
2016-2-6 10:02
32846702.jpg (28.55 KB)
 
顶部
tie8[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 75844
精华 0
积分 442
帖子 543
信誉分 100
可用分 3571
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-28
状态 离线
5
 
看有的国外网站上说,反应效率过高是因为PCR反应饱和所致,表现是有的
CT间隔小于一个cycle,所以导致曲线下压,删掉某些plot可以达到正常的反应效率。可是我这张图上感觉间隔似乎还比较均匀,不知该怎么解释。
就是加样枪不太准,反应体积偏大。不知跟这个有无关系。
顶部
tie8[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 75844
精华 0
积分 442
帖子 543
信誉分 100
可用分 3571
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-28
状态 离线
6
 

还有就是针对同一对引物,在同一种组织中取得的各个标本之间反应效率发现并不一致,不知这样的话如何通过标准曲线的反应效率来检测我的待测标本模版的初始数量。
顶部
079777chao[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 107992
精华 0
积分 321
帖子 301
信誉分 100
可用分 2371
专家分 0
阅读权限 255
注册 2013-4-27
状态 离线
7
 

以5倍浓度梯度稀释的样本的Ct值的差异在扩增效率是100%时为2.32,Ct值差异是否相近(即扩增曲线间隔均匀),决定了相关系数R是否接近于1,Ct值差异大小则决定了扩增效率的高低。以5倍梯度稀释样本来说,Ct差异大于2.32,则扩增效率小于100%,差异越大则扩增效率越小。差异小于2.32,则扩增效率大于100%。你这次实验的Ct值差分别为1.88、1.73、2.19、1.57,差异明显小于2.32,所以导致扩增效率大于100%。
从你的描述来看,个人认为是你的加样枪不准导致梯度样本稀释不准确,即实际样本梯度小于5倍,估计介于2倍到5倍之间。
顶部
911[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 73229
精华 1
积分 523
帖子 682
信誉分 102
可用分 4276
专家分 10
阅读权限 255
注册 2011-9-20
状态 离线
8
 
还有一个原因就是模板不纯,这也会使得扩增效率偏大。
顶部
tie8[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 75844
精华 0
积分 442
帖子 543
信誉分 100
可用分 3571
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-28
状态 离线
9
 


QUOTE:
原帖由 911 于 2016-2-6 10:04 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
还有一个原因就是模板不纯,这也会使得扩增效率偏大。

不懂。能不能说的明白点儿。模板不纯按理应该减小扩增效率啊。
顶部
moonlight[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 76228
精华 0
积分 194
帖子 187
信誉分 100
可用分 1611
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-2
状态 离线
10
 
本人以为,当模板中有抑制PCR反应的物质时,随着稀释度的增加,抑制因子浓度降低,对反应的负面影响降低,导致扩增效率偏高。
顶部