小中大由于本实验室没有real-time仪器，因此将提供好的CDNA交给公司做后面的qPCR，但是公司用染料法做了一次内参之后，说只有两个标本能够跑出来，其他的均不行，我又拿回来做了一下普通的PCR，结果都有很亮的内参条带，公司说是我的标本有问题，但是我不明白，如果真的有问题，为什么我的普通PCR还是能够跑出来的，我前面的提取RNA和逆转录试剂盒都是天根的，而公司用得好像是TAKARA的。
现在公司又重新用染料法（用我的内参）和探针法（他们的内参）重新对我的标本进行检验，发现阴性对照也有表达，认为是污染，但是此次做得染料法的结果和上次的明显不同，而且相对阴性对照都有污染的话，那么从标本的曲线上看表达还是较低的。
因为我对这方面了解不多，所以想请问一下各位高手，有没有碰到过类似的问题，到底是哪里出了问题，我觉得我的标本没有问题啊，而且阴性对照有表达的话，应该是染料等有污染才对啊，也不能说是标本有问题。
而且公司居然把做完qPCR的产物给扔掉了，并没有跑胶，这点我开始也不知道的，他们之说看机器上的条带就可以了。
请各位高手多给些宝贵建议，谢谢
