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标题:【求助】给本科的同学们分享一下我对RNA提取过程的总结哦

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【求助】给本科的同学们分享一下我对RNA提取过程的总结哦

无聊中。。。没啥事情做的,就把自个儿实验的心得加上书上的步骤稍作整理,写一点点小文,赚一点点分数,嘿嘿。。。
特点:RNA不稳定,易降解。
由于核糖残基的2'和3‘位置带有-OH,RNA易于被RNase切割水解。
RNase含量丰富,加热后仍然能够正确折叠,恢复活性,难以失活。
注意事项:1、经常更换新手套,因为皮肤和实验用品上可能有RNase,会导致RNase污染,使用灭菌后的塑料制品和墙头避免交叉污染。
2、应该使用不含RNase的塑料和玻璃器皿,玻璃器皿可以在150度烘烤4小时,塑料器皿可以在0.5MNaOH中浸泡10分钟,然后用水彻底清洗,再灭菌,即可除去RNase。
3、常用RNA酶抑制剂,DEPC。
步骤:
1、材料裂解。
2、杂质的去除。
3、RNA吸附或沉淀。
A、裂解:异硫氰酸呱,巯基乙醇等,使核蛋白复合物变性,释放RNA,有效抑制RNase。
B、去处杂质:苯酚,氯仿,异戊醇抽提去除杂质,使得RNA及蛋白沉淀到有机相
C、研磨材料吸附,或用异丙醇沉淀浓缩RNA。
以经过DEPC处理的水溶液溶解RNA。
材料准备及裂解:
尽量使用新鲜材料,植物组织选取杂质少,生长较快的幼嫩部位,现取现提。组培细胞和血液应该尽量离心去除培养液和上清液,消化系统的组织选取杂质少的部位,细菌和酵母需要匀浆处理。
对不能马上提取的样品切成小块后立即投入液N2冷冻,或者投入专门的样品储存液中保存。
未完待续
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液N2研磨时不要使液N2挥发净,随时补充,加入裂解液并且彻底而迅速地匀浆。
RNA的提取
杂质的抽提
采用有机(酚\氯仿)抽提时应充分混匀。
离心分离两相时,应保持一定的转速和时间,使蛋白质和DNA分布到中间层和有机相中,RNA留在水相中。
对脂肪含量较多的样品注意不要吸入油脂层,可以再次用有机溶剂抽提。
RNA的沉淀和溶解
含有RNA的水相过吸附柱,通过去蛋白液和漂洗液去除蛋白和多糖等杂质。
或使用异丙醇沉淀RNA应充分地混匀并放置10min左右离心收集沉淀。70%酒精洗涤,晾干。用经过DEPC处理过的水或专门的试剂来洗脱或溶解RNA。
样品收集后或需长期保存时应置于-70摄氏度或加入RNase抑制剂,分装使用。
RNA的检测
电泳槽系统的处理,乙二醛化琼脂糖凝胶电泳,含有甲醛的琼脂糖凝胶电泳
RNA纯度及浓度的检测
A260=1 约40微克/mlRNA
A260/280约为1.9-2.1
RNA提取常见问题
1、抽提过程不彻底,存在蛋白质或者多糖多酚的污染
2、DNA污染
3、离子浓度较高
原因对策
1、保证彻底地裂解和一定转数一定时间的离心,增加有机溶剂抽提的次数,用吸附柱纯化。
2、减少处理样品的量,加入不含RNase的DNase处理,再次纯化。
3、增加漂洗次数。
RNA提取常见问题
问题一、RNA样品不纯
1、样品含有杂质杂液。
2、样品过量或者样品裂解,和匀浆不彻底。
3、RNA未有效地吸附沉淀和洗脱。
4、样品RNA含量少。
原因对策
1、去除样品中的杂质,离心除尽样品中的培养基或储存液。
2、减少样品用量,充分研磨样品,增加裂解液的用量和裂解的时间。
3、延长吸附时间或者保证异丙醇沉淀的时间和离心时间,再次洗脱。
4、重复吸附,加入肝糖等有助于RNA沉淀的试剂。
问题二、RNA得率低
1、样品不新鲜或样品保存不当,RNA降解。
2、污染了RNase。
3、样品储存不当。
原因对策
1、尽量取新鲜样品,取样后立即放入液N2保存,或者放入专门的储存液内。研磨样品要及时补充液N2。
2、认真地处理相应的器具和试剂,严格按要求操作。
3、-70摄氏度冻存,分装使用,加入RNase抑制剂。
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楼主不是医学生能分析这些东东,那就是公司复杂实验方面的啦?
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请问LZ用什么裂解液?
我们用的是Trizol,而有的Trizol试剂说明书写这样抽提的RNA的 A260/A280值在1.6-1.8之间,比值大于1.8我们一般考虑为基因组DNA 的污染。我最近一直在做Realtime PCR,用的模板就是通过抽提细胞的RNA经逆转录所得,每次测RNA的纯度(比值)都是1.7-1.8,后续实验的结果也不错。就是很少能把比值做到1.9的
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原帖由 greenbee 于 2016-2-9 22:29 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

请问LZ用什么裂解液?
我们用的是Trizol,而有的Trizol试剂说明书写这样抽提的RNA的 A260/A280值在1.6-1.8之间,比值大于1.8我们一般考虑为基因组DNA 的污染。我最近一直在做Realtime PCR,用的模板就是通过抽提细胞的RNA经 ...

啊??……晕,我用的也是Trizol……会不会是不同牌子的试剂盒里面的成分会有些微妙的差别?我以前看过不同品牌的DNA试剂盒的protocol,不同的品牌的数据标准确实会有微妙的差别。
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原帖由 greenbee 于 2016-2-9 22:29 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

请问LZ用什么裂解液?
我们用的是Trizol,而有的Trizol试剂说明书写这样抽提的RNA的 A260/A280值在1.6-1.8之间,比值大于1.8我们一般考虑为基因组DNA 的污染。我最近一直在做Realtime PCR,用的模板就是通过抽提细胞的RNA经 ...

1.6-1.8也不错的啊,一般来说,做到1.9的是相当好的了,2-2.1的也是比较常见的。
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