小中大【求助】蛋白测序是做N端测序好还是二级质谱好
v我从蘑菇里面提取蛋白,经过初步分离后,SDS-PAGE显示出比较富集的蛋白条带,但是暂时没办法再进一步纯化,由于时间关系想先测个序,但是不知道N端测序和LS-MS-MS测序那个比较好。
我现在不清楚蛋白的纯度,分子量。想做N端测序吧,又怕那个SDS-PAGE条带只是蛋白异质多聚体中的一个亚基,这样的话测N端只是测了一个部分的亚基,意义不大,还得再做,但是做LS-MS-MS吧,我又不太了解,听说这个可以把SDS-PAGE上相同位置上的不同蛋白的序列测出来,但在网上看见这句话“我今天咨询了一下,因为是未知蛋白,工程师的意思好像N端测序是测定,质谱一般用来做鉴定,所以N端测序优先,如果实在测不出来再用质谱。”这个让我很纠结,这句话里面的质谱是指一级质谱吗?怎么和我咨询的不一样呢?
求各位虫友指导!我到底是做N端测序好还是二级质谱好?