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标题:【求助】如何寻找某个基因序列的糖基化位点

薄荷侠[使用道具]
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发表于 2016-2-29 10:39 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】如何寻找某个基因序列的糖基化位点


我现在有一个序列，但我不知如何找出它的糖基化位点？请教了，谢谢！！
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duoduo[使用道具]
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发表于 2016-2-29 10:40 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

氮糖基化的规律：出现N-X-T/S序列可以认定是氮糖基化位点。X代表任意氨基酸。
氧糖基化迄今尚无规律可循。
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fangxiang[使用道具]
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发表于 2016-2-29 10:40 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

首先建议你最好将“基因序列”改成蛋白序列。
如果你想预测某蛋白序列是否存在潜在的糖基化位点，可以到如下网站去在线预测：
1.NetOGlyc - Prediction of O-GalNAc (mucin type) glycosylation sites in mammalian proteins
cuturl('http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/')
2.NetNGlyc - Prediction of N-glycosylation sites in human proteins
cuturl('http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/')
3.YinOYang - O-beta-GlcNAc attachment sites in eukaryotic protein sequences
cuturl('http://www.cbs.dtu.dk/services/YinOYang/')
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发表于 2016-2-29 10:40 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

我是一新手，我想问一下，糖基化位点又意味着什么？？？多谢！！
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薄荷侠[使用道具]
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发表于 2016-2-29 10:41 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


QUOTE:
原帖由 fangxiang 于 2016-2-29 10:40 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

首先建议你最好将“基因序列”改成蛋白序列。
如果你想预测某蛋白序列是否存在潜在的糖基化位点，可以到如下网站去在线预测：
1.NetOGlyc - Prediction of O-GalNAc (mucin type) glycosylation sites in mammalian pro ...

我是一位新手，我试了一下，但有些弄不懂！！请赐教！！多谢！！
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薄荷侠[使用道具]
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发表于 2016-2-29 10:43 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


QUOTE:
原帖由 fangxiang 于 2016-2-29 10:40 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

首先建议你最好将“基因序列”改成蛋白序列。
如果你想预测某蛋白序列是否存在潜在的糖基化位点，可以到如下网站去在线预测：
1.NetOGlyc - Prediction of O-GalNAc (mucin type) glycosylation sites in mammalian pro ...

但是我测了一个基因序列，没有完整的ORF，不能翻译成完整的氨基酸。请帮忙！！
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薄荷侠[使用道具]
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发表于 2016-2-29 10:58 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

请问yioyang中的yinyang代表什么？？多谢！！
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