小中大我接下来要酶切,是一定要把目的基因前面的条带消除的。提高温度我也做了,只是温度提高后,目的基因和杂带有很模糊,什么也看不见了,很是郁闷!
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首先要确定你酶切的目的,是继续做载体连接还是不继续做了,仅仅进行酶切与否的分型。
如果是前者,估计你的样本量应该不多,控制PCR的总量和特异条带的最高亮度的条件,然后进行切胶回收就可以了。
如果是后者,可能相对样本量多一些。都采用切胶回收的方法固然不现实,那我觉得你不妨先不要着急想去除干净非特异性的条带,要想两全其美,起始显示中是比较困难的。你可以尝试用你需要的酶进行酶切,看看酶切后的残余片断是否会由于非特异性扩增而有质的影响。往往,非特异性扩增产物不能被酶切,或者酶切后残余条带明显偏离你需要关注的范围,那样的话是不干扰你进行基因分型的。如果需要回收片断的话,这个时候进行切胶也不晚。
如果确实酶切后,杂带在分子量范围和亮度上都明显干扰目的条带的话,那非常不幸,你必须仔细摸索PCR条件了。