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标题:【求助】Thermo QE和Agilent 6550肿么选?

9900[使用道具]
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你说的对,QE如果联液相使用,高扫描速度的情况下,是发挥不到那么高的分辨率的,有的型号的QE(例如Focus)甚至比QTOF类型的仪器分辨率要差得多
如果你做蛋白组的话,蛋白组的峰你懂的,一坨坨的,一个峰拖了好长时间,扫描速度可以相对慢点,QE还是可以的,你也可以看到Thermo在蛋白组还是有一定优势的
但是,如果你做代谢组学,就不要考虑QE,转向QTOF吧。QE的同位素信息真是丢的不要不要的,做小分子分辨率也不灵了(高扫描速度下,分辨率就降低了),定性很困难。所以,大家都问你做什么。你的研究课题直接决定你买什么仪器。
还有,建议你关注一下相关软件,做代谢组,软件很重要。不要只看硬件。
多找真正在用仪器做实验的人打听,不要盲目的相信各家销售的话,王婆卖瓜没有不自夸的。
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milkdog[使用道具]
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如果是代谢组学研究的话,软件更重要,特别是数据挖掘的过程,当然灵敏度很重要,特别是做内源性化合物的比较时候,如果灵敏度不够,根本就看不到痕量的代谢物,特别是基体很复杂的时候。Orbi用的还是Trap的技术,所以空间电荷积累的效应还是存在,所以复杂基体时候的灵敏度和纯标样的灵敏度没法比,建议还是多多考虑QTOF。而且代谢组学找到差异后需要进行鉴定,现在用的最广泛的就是Metlin的库,这个是QTOF做的,是CID碰撞反应池出来的,和Orbi/QE 用HCD碰撞反应池打出来吃的二级质谱完全不具有参考性,换句话说如果是买Orbi/QE就没有办法使用Metlin进行鉴定啦。
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xevin[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 milkdog 于 2016-3-22 11:10 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
如果是代谢组学研究的话,软件更重要,特别是数据挖掘的过程,当然灵敏度很重要,特别是做内源性化合物的比较时候,如果灵敏度不够,根本就看不到痕量的代谢物,特别是基体很复杂的时候。Orbi用的还是Trap的技术,所以空间电荷积累的 ...

灵敏度不够一直是QTOF类产品的软肋,QTOF获取高分辨率是要消耗一定量的样品的,所以QTOF设置参数中区分有高分辨和高灵敏度两种模式,高分辨和灵敏度是互相制约的关系。对于Orbitrap来说,高分辨和扫描速度是互相制约关系,但高分辨和高灵敏度可以同时获得,这也是为啥QE可以同时做定性和定量。
对于Trap技术,很多人将IT离子阱和Orbitrap轨道阱混为一谈,这是两种质谱技术,IT离子阱是低分辨的质量分析器,Orbi轨道阱是高分辨质量分析器和无损检测器。然后就说凡是Trap都有空间电荷抑制效应。复杂基体时候的灵敏度和纯标样的灵敏度是没法比,但我还从来没见过任何质谱检测复杂基质样品灵敏度能超过标样的。如果连标样灵敏度都做不好,更别提复杂基质样品了。
对于复杂基质样品,高分辨和高灵敏度才是代谢检测的关键因素。因此Orbitrap在灵敏度这方面完胜QTOF,不相信的话可以送标样做工作曲线,用基质盲样定量考核。
目前我看过的QE小分子配置都是接UHPLC,一个色谱峰常规在10s以上,超高压条件下最窄也得2-3s吧。质谱扫描速度都是ms为单位计时,常规定性定量一个色谱峰采集10个点即可,说Orbi扫描速度慢的还是先等液相色谱出峰缩短到1s以内再说吧。
代谢组学现在用的最广泛的就是Metlin的库,这个是安捷伦QTOF做的,如果依赖Metlin数据库来做实验时的确优先考虑QTOF,不过数据库不是万能的,毕竟这又不是气质的NIST,还是根据自己的实验设计吧。
现在质谱技术发展很快,论坛很多人还停留在远古时代,带有色眼镜去分析真的应该回炉重新学习了。
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xevin[使用道具]
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复杂样品 代谢组学,你就不用考虑QE了。
要接超高效液相,你更不用考虑QE了。
你的应用方向Q-TOF更合适。

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一看就是砖家,我还是。
复杂样品代谢组学,你就不用考虑QE了。    国内代谢组学做的最多的中科院大连化物所有3台以上QE
要接超高效液相,你更不用考虑QE了。      我见过QE小分子配置基本都是接UHPLC;大分子因为样品量少,为了获取更高的灵敏度采用Nano LC
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vera+[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 xevin 于 2016-3-22 11:11 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
复杂样品 代谢组学,你就不用考虑QE了。
要接超高效液相,你更不用考虑QE了。
你的应用方向Q-TOF更合适。

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去年冬天大化所许老师办代谢组学培训班 许老师实验室是各个厂家的仪器都有的吧........
我们组qe是连的nano lc 做蛋白组学 mascot也用的 但代谢组学的确用qtof
QE做代谢真的不行啊 sieve也没人教功能也太少 我们只能xcms自己写代码
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