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标题:【求助】如何根据基因的rs号查是哪个点的SNP

小鱼鱼[使用道具]
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发表于 2016-4-4 10:22 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】如何根据基因的rs号查是哪个点的SNP

刚接手一个数据库，里面都是rs号，也没有说明是哪个基因，好容易搜到了是某个基因的一些点，但却不知道怎么和文献发表的结果对应。因为大多数文献都是发表的A数字C，或直接表示为氨基酸改变。
怎么确定这种对应关系啊。谢谢高手们！
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大尾巴[使用道具]
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发表于 2016-4-4 10:23 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

这个工作量很大的，我也不知道简便的方法。用的都是土方法，利用rs号，直接在NCBI的SNP库里确定是那个基因的。想找到相关的文献，我一直没有找到解决方法
楼主有好的方法，还望告知
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黄花菜[使用道具]
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发表于 2016-4-4 10:23 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

可不可以先根据基因 到omim
HGVS cuturl('www.hgvs.org/')
HGMD cuturl('www.hgmd.cf.ac.uk/')
DAGdb
cuturl('www.ebi.ac.uk/mutations/')
数据库里去找，那里收录了很多和疾病有关的SNP
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utt0989[使用道具]
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发表于 2016-4-4 10:26 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

那个不全
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viviwang1987[使用道具]
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发表于 2016-4-4 10:27 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

polydoms 网站cuturl('http://polydoms.cchmc.org/polydoms/')
可以批量输入rs号进行查询
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damingxia0904[使用道具]
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发表于 2016-4-4 10:27 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
各位，告诉你们RS号是唯一的，只要知道这个号，就很方便的知道序列和基因了，想知道的来问我
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发表于 2016-4-4 10:27 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

有时多个rS号是指一个位点。
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vvmmoy[使用道具]
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发表于 2016-4-4 10:28 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

我也一样啊，手头有一批SNP的RS号，想知道位于基因的什么位置~~ 楼主有答案了吗？
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avi317[使用道具]
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发表于 2016-4-4 10:29 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

各位楼楼有答案了吗？俺刚开始做这方面的研究，请教啊！
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了了[使用道具]
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发表于 2016-4-4 10:29 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
我也一样啊，手头有一批SNP的RS号，想知道位于基因的什么位置~~ 楼主有答案了吗？

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请问你后来找到方法了吗？
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