小中大所用protocol:
2.2 DNA修饰
2.2.1 取旋盖1.5ml离心管,加水100µL,再加1.0µg DNA,最后加7µL 3M NaOH,混匀。
如样品中DNA不足1.0µg时,加 DNA 修饰试剂IV,补水使总体积达到100µL,然后加7µL 3M NaOH,混匀。
(98µL水 + 2µL DNA 修饰试剂 IV + DNA样品 + 7µL 3M NaOH)
2.2.2 50℃ 10min
2.2.3 加550µL新鲜配制的DNA 修饰试剂 I,漩涡混匀。
2.2.4 50℃ 16h。
2.3 完成化学修饰,DNA洗涤
2.3.1 重悬试剂Ⅲ,漩涡混匀,确保混匀。
2.3.2 取重悬好的试剂Ⅲ5µL至上述DNA溶液中,再加入750µL试剂Ⅱ,轻轻混匀。
2.3.3 室温孵育5-10min,5000g 离心10sec,弃上清。
2.3.4 加1ml70%乙醇,漩涡混匀,5000g 离心10sec,重复三次。
2.3.5 第三次去除上清后,再高速离心2min,吸去残存的上清。
2.3.6 加50µL 20mM NaOH/90% 依存与上述样品中,漩涡混匀,重悬沉淀物,室温孵育5min。
2.3.7 5000g 离心10sec,直接加1ml90%乙醇,漩涡混匀,洗涤沉淀,离心弃上清,重复两次。
2.3.8 第二次上清去除后,再高速离心3min, 吸去残存的上清,室温干燥10-20min.
2.3.9 加TE Buffer(10mmTris/0.1mmEDTA,pH7.5)漩涡混匀。Buffer的量取决于开始时DNA的量。(一般25-50µL)
2.3.10 50-60℃ 15min。高速离心2-3min,转移上清至另一Ep管中。
2.3.11 进行MSP或sequenceing,或储存-15℃~-25℃,可保存两个月;-80℃六个月。可分装,避免反复冻融。
2.3.12 当保存的样品融化后作MSP时,避免将析出的试剂Ⅲ加入,可先离心去除沉淀。