小中大软件的引物设计功能主要体现在两个方面:首先是引物分析评价功能,该功能只有少数商业版软件能够做到,其中以“Oligo”最优秀;其次是引物设计功能,各种软件在这方面的侧重不同,因此自动搜索的结果也不尽相同。根据经验,自动搜索功能以“"Primr premier"最强且方便使用,Oligo其次,其他软件如”Vector NTI Suit“,"Dnasis","Omiga"和"Dnastar"都带有引物自动搜索功能,但搜索的结果不是十分理想。要想得到效果很好的引物,在自动搜索的基础上还要辅以人工分析,引物设计方面的最佳搭配是"Primr premier"+“Oligo”,以"Primr premier"进行自动搜索,以“Oligo”进行分析评价,如此可快速设计出功率很高的引物。