小中大怎么证明酸性峰或者碱性峰是目标蛋白的电荷异质体而不是其他分子大小和电荷性质类似的杂质呢？仅靠SDS-PAGE或者是HPLC（SEC）能说明是单一组分吗？
现在我的问题是，我的一个蛋白，SDS-PAGE和HPLC检测结果都是高纯度的，但是等点聚焦跑出来有好几条带，而且这几条带粗细差不多，看不出哪个是主带，这说明什么呢？我的蛋白的异构体太多了吗？如果是这样的话，去报药的话，中检所的老师会提出质疑吗？我该如何解释我等点聚焦的结果呢？
入行不久，经验不多，请各个大神指点迷津~~
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个人认为大分子中是不存在绝对的单一组分，只是分析原理不同，出现相对的单一组分。 正如你所说，SDS-PAGE SEC一条带，只能说明在这两个方法检测限内的单一组分，即分子量类似的蛋白。 （进一步鉴定分子量，还得通过质谱检测。 ）
但若你换成离子交换，疏水、等点聚焦等其他分析方法，又会相应出现其他杂带，也即相应的电荷异构体、疏水异构体，这样又表明该大分子并不是单一组分。
等点聚焦出现N条条带，说明你的电荷异构体还比较多，进一步通过毛细管等电电泳、阳离子交换等做进一步电荷异构体鉴定，进而做翻译后修饰 PTM的鉴别，看看是什么原因引起这么多电荷异构体。
关于中检所老师提问， 你做的是仿制药还是原研？ 仿制尽可能一致，，原研去解释每个杂带的大致形成原因，以及对生物活性、免疫原性的影响，这时可能就得单独分离后去做实验。
附上一篇 韩国如何与原研类克对比的文章 里面有提及电荷异构体差异 cuturl('http://d.dxy.cn/detail/7425385')
有篇文献Physicochemical and Functional Comparability Between the Proposed Biosimilar Rituximab GP2013 and Originator Rituximab 讲利妥昔与其类似的对比中，CEX图谱GP2013有个多余的碱性峰，为脯氨酸酰化，之后通过制备得到高AP化的单抗，做活性研究，PK/PD研究，毒性研究，，过程很复杂，，
